<div dir="ltr">Dear all,<div><br></div><div>we're currently rethinking our high content screening workflow and thus I'm thinking about a good way to store all data.</div><div>My idea is to create one e.g. HDF5 file per plate which contains all the images + meta data.</div><div>Do  have any recommendations regarding that (I think Mario once triggered a discussion around that topic) ?</div><div><br></div><div>If some kind of HDF5 is considered as solution - then still a structure specification would be needed. </div><div>Kai and Nico mentioned the CellH5 format, a flavor of HDF5.</div><div>As far as I can see this is supported by bioformats / Omero. However, it's still unclear how</div><div>to pack the output of a e.g. Opera machine into a CellH5 format in a convenient way.</div><div><br></div><div>In addition there was a discussion about an official OME-HDF5 format, right? </div><div>What's the current status for that?</div><div><br></div><div>Thanks a lot in advance for any fruitful input for this topic!</div><div><br></div><div>Regards,</div><div>Manuel</div><div><br></div><div><br></div><div><div><br></div></div></div>

<br>
<div><br></div><div><div><font size="2">The information of this email and in any file transmitted with it is strictly confidential and may be legally privileged.</font></div><div><font size="2">It is intended solely for the addressee. If you are not the intended recipient, any copying, distribution or any other use of this email is prohibited and may be unlawful. In such case, you should please notify the sender immediately and destroy this email.</font></div><div><font size="2">The content of this email is not legally binding unless confirmed by letter.</font></div><div><font size="2">Any views expressed in this message are those of the individual sender, except where the message states otherwise and the sender is authorized to state them to be the views of the sender's company.</font></div></div>