<div dir="auto"><div>Hi <span style="font-family:sans-serif">Giovanni</span></div><div dir="auto"><font face="sans-serif"><br></font></div><div dir="auto"><font face="sans-serif">Sounds like a bug in the bioformats DV reader </font></div><div dir="auto"><font face="sans-serif"><br></font></div><div dir="auto"><font face="sans-serif">Please upload a small as possible DV file and matching log file to the bioformats team and then it will be possible to find and squash the bug. </font></div><div dir="auto"><font face="sans-serif"><br></font></div><div dir="auto"><font face="sans-serif">Did you use any advanced experiment t setup like points or panels? </font></div><div dir="auto"><font face="sans-serif">How many colour channels? </font></div><div dir="auto"><font face="sans-serif"><br></font></div><div dir="auto"><font face="sans-serif">Best</font></div><div dir="auto"><font face="sans-serif"><br></font></div><div dir="auto"><font face="sans-serif">Dan<br></font><br><div class="gmail_quote" dir="auto"><div dir="ltr">On Mon, 1 Oct 2018, 15:53 Cardone, Giovanni, <<a href="mailto:cardone@biochem.mpg.de">cardone@biochem.mpg.de</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">





<div lang="EN-US" link="#0563C1" vlink="#954F72">
<div class="m_6019231121479841597WordSection1">
<p class="MsoNormal">Hi,<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal">recently a user of the DeltaVision at our facility has experienced an issue with opening a .dv file in Fiji (bio-formats 5.9.2). Specifically, the series is made of 944 time points, three channels of 640x640 images. When trying to open
 it, it is split into four non sequential series of 236 time points each, generated by interleaving: first series contains 1^st, 5^th, 9^th … time points, second series 2^nd, 6^th, 10^th … time points,
 and so on.<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">This issue appears randomly: for example, another series acquired the same day, 1024x1024 pixels, 3 channels, 560 time points, is properly opened as a single series.<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">The software installed on the microscope computer has been recently updated to SoftWoRx 7.0.0 RC6.<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">I tried to open the file with ICY, and the result is the same. The only software that we have and that could open it properly is Volocity 6.3.<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Did anyone else experience this problem? <u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Thanks,<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Giovanni Cardone<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal">Imaging Facility<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Max Planck Institute of Biochemistry<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Martinsried, Germany<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
</div>

_______________________________________________<br>
ome-users mailing list<br>
<a href="mailto:ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk" target="_blank" rel="noreferrer">ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk</a><br>
<a href="http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users" rel="noreferrer noreferrer" target="_blank">http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users</a><br>
</blockquote></div></div></div>