<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
<style type="text/css" style="display:none;"><!-- P {margin-top:0;margin-bottom:0;} --></style>
</head>
<body dir="ltr">
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:#000000;font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;" dir="ltr">
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0">Hi <span>Mohanapriya,</span></p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><span><br>
</span></p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><span>Converting pyramidal levels to<span style="font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif, Helvetica, EmojiFont, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", NotoColorEmoji, "Segoe UI Symbol", "Android Emoji", EmojiSymbols; font-size: 16px;"> ome-tiff
 (if that's what you're looking</span><span style="font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif, Helvetica, EmojiFont, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", NotoColorEmoji, "Segoe UI Symbol", "Android Emoji", EmojiSymbols; font-size: 16px;"> for)</span> is
 not possible at the moment, unfortunately. </span></p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><span><br>
</span></p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><span>However, it is something we are working towards and will hopefully have support for converting soon.</span></p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><span><br>
</span></p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><span>If you would like to follow our progress, you can find our
<a href="http://openmicroscopy.github.io/design/OME005/" class="OWAAutoLink" id="LPlnk181444" previewremoved="true">
design document here</a> and the open <a href="https://github.com/openmicroscopy/bioformats/pull/3189" class="OWAAutoLink" id="LPlnk696917" previewremoved="true">
pull requests here</a>.</span><br>
</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><span><br>
</span></p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><span>Thanks</span></p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><span><br>
</span></p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><span>Riad</span></p>
</div>
<hr style="display:inline-block;width:98%" tabindex="-1">
<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" style="font-size:11pt" color="#000000"><b>From:</b> ome-users <ome-users-bounces@lists.openmicroscopy.org.uk> on behalf of Narapareddy, Mohanapriya <mohanapriya.narapareddy@emory.edu><br>
<b>Sent:</b> 08 August 2018 18:03:47<br>
<b>To:</b> OME User Support List<br>
<b>Subject:</b> Re: [ome-users] Issue in bfconvert command.</font>
<div> </div>
</div>
<meta content="text/html; charset=us-ascii">
<style type="text/css" style="display:none">
<!--
p
        {margin-top:0;
        margin-bottom:0}
-->
</style>
<div dir="ltr">
<div id="x_divtagdefaultwrapper" dir="ltr" style="font-size:12pt; color:#000000; font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif">
<p style="margin-top:0; margin-bottom:0">I mean the pyramidal levels. Only the series 0 is converted from vsi to tiff format. Unable to convert other series levels</p>
<p style="margin-top:0; margin-bottom:0"><br>
</p>
<div id="x_Signature">
<p>Mohanapriya</p>
</div>
</div>
<hr tabindex="-1" style="display:inline-block; width:98%">
<div id="x_divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" color="#000000" style="font-size:11pt"><b>From:</b> ome-users <ome-users-bounces@lists.openmicroscopy.org.uk> on behalf of Riad Gozim (Staff) <r.gozim@dundee.ac.uk><br>
<b>Sent:</b> Wednesday, August 8, 2018 12:18:38 PM<br>
<b>To:</b> ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk<br>
<b>Subject:</b> Re: [ome-users] Issue in bfconvert command.</font>
<div> </div>
</div>
<meta content="text/html; charset=us-ascii">
<style type="text/css" style="display:none">
<!--
p
        {margin-top:0;
        margin-bottom:0}
-->
</style>
<div dir="ltr">
<div id="x_x_divtagdefaultwrapper" dir="ltr" style="font-size:12pt; color:#000000; font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif">
<p style="margin-top:0; margin-bottom:0">Hi <span>Mohanapriya</span><span>,</span></p>
<p style="margin-top:0; margin-bottom:0"><span><br>
</span></p>
<p style="margin-top:0; margin-bottom:0"><span>Could you clarify what you mean by "layers"? We're not sure if you mean <span>subresolution/pyramidal levels, channels, or something else.</span></span></p>
<p style="margin-top:0; margin-bottom:0"><span><span><br>
</span></span></p>
<p style="margin-top:0; margin-bottom:0"><span><span>Thanks,</span></span></p>
<p style="margin-top:0; margin-bottom:0"><span><span>Riad</span></span></p>
</div>
<hr tabindex="-1" style="display:inline-block; width:98%">
<div id="x_x_divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" color="#000000" style="font-size:11pt"><b>From:</b> ome-users <ome-users-bounces@lists.openmicroscopy.org.uk> on behalf of Narapareddy, Mohanapriya <mohanapriya.narapareddy@emory.edu><br>
<b>Sent:</b> 08 August 2018 16:37:39<br>
<b>To:</b> ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk<br>
<b>Subject:</b> [ome-users] Issue in bfconvert command.</font>
<div> </div>
</div>
<meta content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none">
<!--
p
        {margin-top:0;
        margin-bottom:0}
-->
</style>
<div dir="ltr">
<div id="x_x_x_divtagdefaultwrapper" dir="ltr" style="font-size:12pt; color:#000000; font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif">
<p style="margin-top:0; margin-bottom:0"></p>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; font-size:16px; margin-top:0px; margin-bottom:0px">
Hello,</div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; font-size:16px; margin-top:0px; margin-bottom:0px">
<br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; font-size:16px; margin-top:0px; margin-bottom:0px">
when i try to convert the vsi file in to tiff file in the docker container, i am unable to convert all the layers of the vsi file properly. I just wanted to know whether the bfconvert command works properly in the docker container and also wanted to know how
 can i fix this issue.</div>
<div id="x_x_x_Signature" style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; font-size:16px">
<div style="margin-top:0px; margin-bottom:0px"><br>
</div>
<div style="margin-top:0px; margin-bottom:0px"><br>
</div>
<div style="margin-top:0px; margin-bottom:0px">Mohanapriya</div>
</div>
<br>
<p></p>
<p style="margin-top:0; margin-bottom:0"><br>
</p>
<div id="x_x_x_Signature">
<p><br>
</p>
</div>
</div>
<br>
<hr>
<font face="Arial" color="Gray" size="1"><br>
This e-mail message (including any attachments) is for the sole use of<br>
the intended recipient(s) and may contain confidential and privileged<br>
information. If the reader of this message is not the intended<br>
recipient, you are hereby notified that any dissemination, distribution<br>
or copying of this message (including any attachments) is strictly<br>
prohibited.<br>
<br>
If you have received this message in error, please contact<br>
the sender by reply e-mail message and destroy all copies of the<br>
original message (including attachments).<br>
</font></div>
<br>
<span style="font-size:10pt">The University of Dundee is a registered Scottish Charity, No: SC015096</span>
</div>
</div>
<br>
<span style="font-size:10pt;">The University of Dundee is a registered Scottish Charity, No: SC015096</span>
</body>
</html>