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<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">

</head>

<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">

Hi Stephane,

<div class=""><br class="">

</div>

<div class="">Thank you for submitting the bug report and providing a sample file. I have been able to reproduce the issue as you described and have discovered that the problem was introduced with Bio-Formats 5.7.1 and onwards.</div>

<div class=""><br class="">

</div>

<div class="">I have opened a Trello card on the Bio-Formats inbox to track the issue:</div>

<div class=""><a href="https://trello.com/c/7pSOeMJF/262-big-tiff-breakage-in-571" class="">https://trello.com/c/7pSOeMJF/262-big-tiff-breakage-in-571</a></div>

<div class=""><br class="">

</div>

<div class="">With Thanks,</div>

<div class="">David Gault</div>

<div class=""><br class="">

<div>

<blockquote type="cite" class="">

<div class="">On 24 Jul 2018, at 15:42, Stephane Dallongeville <<a href="mailto:stephane.dallongeville@pasteur.fr" class="">stephane.dallongeville@pasteur.fr</a>> wrote:</div>

<br class="Apple-interchange-newline">

<div class="">Dear Bio-Formats developers,<br class="">

<br class="">

Recently we started to experience an issue while opening some big TIF images with Bio-Formats where returned pixels are all set to 0.<br class="">

We used to open these images normally with older version of Bio-format (5.6.0 is ok).<br class="">

<br class="">

I uploaded an image sample here to reproduce the issue :<br class="">

<a href="https://1drv.ms/u/s!Ah_GQtZzIFGpg5MLYHtEryJ71fTEng" class="">https://1drv.ms/u/s!Ah_GQtZzIFGpg5MLYHtEryJ71fTEng</a><br class="">

<br class="">

As the image size is over > 2GPixels i used to open a sub resolution or just a region of the image but in both cases all returned pixels are 0. Hope it can help you in fixed the problem :)<br class="">

<br class="">

Best,<br class="">

<br class="">

--<br class="">

Stephane Dallongeville<br class="">

Unité d'Analyse d'Images Biologiques<br class="">

CNRS UMR 3691<br class="">

Institut Pasteur<br class="">

25 rue du Dr. Roux<br class="">

75724 Paris cedex 15 (FRANCE)<br class="">

<br class="">

Tel: +33 (0)1 45 68 87 01<br class="">

Fax: +33 (0)1 40 61 33 30<br class="">

<br class="">

http://www.bioimageanalysis.org/<br class="">

<br class="">

_______________________________________________<br class="">

ome-users mailing list<br class="">

ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk<br class="">

http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users<br class="">

</div>

</blockquote>

</div>

<br class="">

</div>

<br>

<span style="font-size:10pt;">The University of Dundee is a registered Scottish Charity, No: SC015096</span>

</body>

</html>