<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">Dear Mark,<div class=""><br class=""></div><div class="">thanks for the explanation! Indeed those are big endian pyramids, understood.</div><div class=""><br class=""></div><div class="">Best regards, Sascha</div><div class=""><br class=""><div class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class=""><div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class=""><div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class=""><div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class=""><div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class=""><div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class=""><div class=""><div class="">--</div><div class=""><div apple-content-edited="true" style="font-family: monospace;" class="">Sascha Neinert<br class="">CECAD RRZK IT Service</div><div apple-content-edited="true" style="font-family: monospace;" class="">Regional Computing Center (RRZK)<br class="">University of Cologne<br class="">Phone: +49-221 478-84051 / +49-221 470-89624<br class="">Mail: <a href="mailto:sascha.neinert@uni-koeln.de" class="">sascha.neinert@uni-koeln.de</a></div></div></div><div class=""><br class=""></div></div></div></div></div></div><br class="Apple-interchange-newline"></div><br class="Apple-interchange-newline"><br class="Apple-interchange-newline">
</div>
<div><br class=""><blockquote type="cite" class=""><div class="">Am 23.04.2018 um 12:04 schrieb Mark Carroll <<a href="mailto:m.t.b.carroll@dundee.ac.uk" class="">m.t.b.carroll@dundee.ac.uk</a>>:</div><br class="Apple-interchange-newline"><div class=""><div class="">On 04/20/2018 01:01 PM, Sascha Neinert wrote:<br class=""><br class=""><blockquote type="cite" class="">to simplify i look at one image only that i have imported twice into the<br class="">same server instance:<br class=""></blockquote><br class="">Good idea.<br class=""><br class=""><blockquote type="cite" class="">1) ID as shown in OMERO.web = 823 and import date = 2018-02-21 11:54:19,<br class="">there is one file …/Pixels/823_pyramid of size 32 MB, time stamp is Feb<br class="">21 12:55<br class="">2) ID as shown in OMERO.web = 958, there is also one file<br class="">…/Pixels/958_pyramid but of size 16 MB<br class=""></blockquote><br class="">I can confirm that I see that same pyramid size difference with your<br class="">image between the two OMERO versions. I'm further guessing that your two<br class="">images are owned by the same user and in the same group.<br class=""><br class=""><blockquote type="cite" class="">In both cases the table pixels has the same value for ‚id‘ and for<br class="">‚image‘, so i guess that the pyramid files i found are the corresponding<br class="">ones.<br class=""></blockquote><br class="">That's plausible but don't assume it will be the case for future images. (-:<br class=""><br class=""><blockquote type="cite" class="">I do not really know how to interpret this behaviour - it could be<br class="">harmless and/or working as intended, it just seemed somehow unusual to<br class="">me.<br class=""></blockquote><br class="">Your original post mentioned using the --endian=little option. In my<br class="">experiments the 5.4.0 server gives your image what it detects as being a<br class="">big-endian pyramid and in 5.4.5 a little-endian one. If you try your<br class="">command with --endian=big then I bet you see 823 come up. If you do<br class="">delete that old one then when you try to view the image OMERO will<br class="">create a new little-endian pyramid for it.<br class=""><br class="">-- Mark<br class=""><br class="">The University of Dundee is a registered Scottish Charity, No: SC015096<br class="">_______________________________________________<br class="">ome-users mailing list<br class=""><a href="mailto:ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk" class="">ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk</a><br class="">http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users<br class=""></div></div></blockquote></div><br class=""></div></body></html>