<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=Windows-1252">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; color: rgb(0, 0, 0); font-size: 14px; font-family: Calibri, sans-serif;">
<div>Hi Dave</div>
<div><br>
</div>
<div>I have opened a PR with an example on how to create a map annotation and add link it to an image </div>
<div>using the Java Gateway</div>
<div><a href="https://github.com/openmicroscopy/openmicroscopy/pull/5601">https://github.com/openmicroscopy/openmicroscopy/pull/5601</a></div>
<div><br>
</div>
<div>Hope it helps</div>
<div><br>
</div>
<div>Cheers</div>
<div><br>
</div>
<div>Jmarie</div>
<span id="OLK_SRC_BODY_SECTION">
<div style="font-family:Calibri; font-size:11pt; text-align:left; color:black; BORDER-BOTTOM: medium none; BORDER-LEFT: medium none; PADDING-BOTTOM: 0in; PADDING-LEFT: 0in; PADDING-RIGHT: 0in; BORDER-TOP: #b5c4df 1pt solid; BORDER-RIGHT: medium none; PADDING-TOP: 3pt">
<span style="font-weight:bold">From: </span>ome-users <<a href="mailto:ome-users-bounces@lists.openmicroscopy.org.uk">ome-users-bounces@lists.openmicroscopy.org.uk</a>> on behalf of jmarie burel <<a href="mailto:j.burel@dundee.ac.uk">j.burel@dundee.ac.uk</a>><br>
<span style="font-weight:bold">Reply-To: </span>OME User Support List <<a href="mailto:ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk">ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk</a>><br>
<span style="font-weight:bold">Date: </span>Tuesday, 12 December 2017 at 18:21<br>
<span style="font-weight:bold">To: </span>OME User Support List <<a href="mailto:ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk">ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk</a>><br>
<span style="font-weight:bold">Subject: </span>Re: [ome-users] Example for MapAnnotation in Java bindings<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>
<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; color: rgb(0, 0, 0); font-size: 14px; font-family: Calibri, sans-serif;">
<div>Dear Dave</div>
<div><br>
</div>
<div>Thanks for your feedback. This is greatly appreciated</div>
<div><br>
</div>
<div>We will prepare an example of Map Annotations in Java in the coming days.</div>
<div>Following Balaji’s feedback, we  will also adjust one of the exercises to use Map annotation instead of tag so it can record the parameters.</div>
<div>By IJ1 code, do you mean macro? </div>
<div>Anything that we could convert and include in some of the training material or is it too specific to your need?</div>
<div><br>
</div>
<div>Thanks again</div>
<div><br>
</div>
<div>Jmarie</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<span id="OLK_SRC_BODY_SECTION">
<div style="font-family:Calibri; font-size:11pt; text-align:left; color:black; BORDER-BOTTOM: medium none; BORDER-LEFT: medium none; PADDING-BOTTOM: 0in; PADDING-LEFT: 0in; PADDING-RIGHT: 0in; BORDER-TOP: #b5c4df 1pt solid; BORDER-RIGHT: medium none; PADDING-TOP: 3pt">
<span style="font-weight:bold">From: </span>ome-users <<a href="mailto:ome-users-bounces@lists.openmicroscopy.org.uk">ome-users-bounces@lists.openmicroscopy.org.uk</a>> on behalf of "Mason, David [dnmason]" <<a href="mailto:D.N.Mason@liverpool.ac.uk">D.N.Mason@liverpool.ac.uk</a>><br>
<span style="font-weight:bold">Reply-To: </span>OME User Support List <<a href="mailto:ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk">ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk</a>><br>
<span style="font-weight:bold">Date: </span>Tuesday, 12 December 2017 at 15:21<br>
<span style="font-weight:bold">To: </span>"<a href="mailto:ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk">ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk</a>" <<a href="mailto:ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk">ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk</a>><br>
<span style="font-weight:bold">Subject: </span>[ome-users] Example for MapAnnotation in Java bindings<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div><style type="text/css" style="display:none;"><!-- P {margin-top:0;margin-bottom:0;} --></style>
<div dir="ltr">
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:#000000;font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;" dir="ltr">
<p>Firstly, I was at the Cambridge OMERO training last Friday and it was really useful, so a big thanks to Will, Balaji, Petr and all else involved behind the scenes.</p>
<p><br>
</p>
<p>I have a whole library of IJ1 code (that i can easily convert to Java) that I want to run client side on our OMERO server and I think MapAnnotations are a great way to record processing / ImageAnalysis parameters.
<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>Would it be possible for someone to provide an example snippet for MapAnnotations (as there is for python here:
<a href="https://docs.openmicroscopy.org/omero/5.4.1/developers/Python.html#write-data" class="OWAAutoLink">
https://docs.openmicroscopy.org/omero/5.4.1/developers/Python.html#write-data</a><span class="OWAAutoLink"> ) but in Java. There is not one present on the equivalent Java bindings page and I'm having a hard time transcoding the python.</span><a href="https://docs.openmicroscopy.org/omero/5.4.1/developers/Python.html#write-data" class="OWAAutoLink"></a><br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>Many Thanks!<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>Dave<br>
</p>
</div>
</div>
</div>
</span><br>
<span style="font-size:10pt;">The University of Dundee is a registered Scottish Charity, No: SC015096</span></div>
</div>
</span><br>
<span style="font-size:10pt;">The University of Dundee is a registered Scottish Charity, No: SC015096</span>
</body>
</html>