<html xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
<meta name="Title" content="">
<meta name="Keywords" content="">
<meta name="Generator" content="Microsoft Word 15 (filtered medium)">
<style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:"Courier New";
        panose-1:2 7 3 9 2 2 5 2 4 4;}
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri",sans-serif;}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:blue;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:purple;
        text-decoration:underline;}
p
        {mso-style-priority:99;
        mso-margin-top-alt:auto;
        margin-right:0in;
        mso-margin-bottom-alt:auto;
        margin-left:0in;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri",sans-serif;}
pre
        {mso-style-priority:99;
        mso-style-link:"HTML Preformatted Char";
        margin:0in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:10.0pt;
        font-family:"Courier New",serif;}
span.HTMLPreformattedChar
        {mso-style-name:"HTML Preformatted Char";
        mso-style-priority:99;
        mso-style-link:"HTML Preformatted";
        font-family:"Courier",serif;}
span.EmailStyle20
        {mso-style-type:personal-reply;
        font-family:"Calibri",sans-serif;
        color:windowtext;}
span.msoIns
        {mso-style-type:export-only;
        mso-style-name:"";
        text-decoration:underline;
        color:teal;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;
        font-size:10.0pt;}
@page WordSection1
        {size:595.0pt 842.0pt;
        margin:1.0in 1.0in 1.0in 1.0in;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style>
</head>
<body bgcolor="white" lang="EN-GB" link="blue" vlink="purple">
<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-US">Dear Kai,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-US"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-US">Thank you for sharing your issue and the file associated with the same.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-US"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-US">There seems to be an issue with reading the dimensions appropriately in this file and I have created a card on this front,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-US"><a href="https://trello.com/c/n6KSnhed/198-axioscan-czi-file-dimensions-issue">https://trello.com/c/n6KSnhed/198-axioscan-czi-file-dimensions-issue</a><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-US"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-US">This will get reviewed at the earliest.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-US">Please follow the card to get more updates on the same.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-US"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-US">Hope that helps.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-US">Best,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-US">Balaji<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-US"><o:p> </o:p></span></p>
<div style="border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:12.0pt;color:black">From: </span></b><span style="font-size:12.0pt;color:black">ome-users <ome-users-bounces@lists.openmicroscopy.org.uk> on behalf of Kai Schleicher <kai.schleicher@unibas.ch><br>
<b>Reply-To: </b>OME User Support List <ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk><br>
<b>Date: </b>Thursday, 9 November 2017 at 13:56<br>
<b>To: </b>"ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk" <ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk><br>
<b>Subject: </b>[ome-users] Axioscan czi opens cropped in Fiji<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<p>Dear OME-team,<o:p></o:p></p>
<p>A user of ours has encountered a curious problem when working with <a href="https://filesender.switch.ch/filesender/?vid=7989119a-b2e4-ef49-8b2b-00005705c75a">
his *.czi files</a> generate by the Zeiss Axioscan Slidscanner.<o:p></o:p></p>
<p>In Brief, the images Open fine in Zen 2 and are complete. They do also open in the latest Fiji, but appear to be cropped (see screenshot attached).<o:p></o:p></p>
<p>Do you have an idea what could have happened here?<o:p></o:p></p>
<p>As always, thanks for your support and greetings from Basel,<br>
Kai<o:p></o:p></p>
<pre>-- <o:p></o:p></pre>
<pre>>>Please note my NEW PHONE NUMBERS: +41 61 207 57 31 (direct) +41 61 207 22 50 (central)<<<o:p></o:p></pre>
<pre>Kai Schleicher, PhD | Research Associate in Advanced Light Microscopy | Biozentrum, University of Basel | Klingelbergstrasse 50/70 | CH-4056 Basel |<o:p></o:p></pre>
<pre>Phone: +41 61 207 57 31 (direct) +41 61 207 22 50 (central) | <a href="mailto:kai.schleicher@unibas.ch">kai.schleicher@unibas.ch</a> | <a href="http://www.biozentrum.unibas.ch">www.biozentrum.unibas.ch</a> | <a href="http://www.microscopynetwork.unibas.ch">www.microscopynetwork.unibas.ch</a><o:p></o:p></pre>
</div>
<br>
<span style="font-size:10pt;">The University of Dundee is a registered Scottish Charity, No: SC015096</span>
</body>
</html>