<html>

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">

</head>

<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">

Hi Qi,

<div class=""><br class="">

</div>

<div class="">Currently Bio-Formats does not support ICC profiles and as such there is no additional processing of the pixel data.</div>

<div class="">If you are able to provide a sample file along with a code snippet showing how you are extracting the ROI and the expected outcome, then we may be able to assist you further.</div>

<div class=""><br class="">

</div>

<div class="">You can upload any sample file to <a href="https://www.openmicroscopy.org/qa2/qa/upload/" class="">https://www.openmicroscopy.org/qa2/qa/upload/</a> </div>

<div class=""><br class="">

</div>

<div class="">With Thanks,</div>

<div class="">David Gault</div>

<div class=""><br class="">

<div>

<blockquote type="cite" class="">

<div class="">On 26 Sep 2017, at 14:41, Qi Gong <<a href="mailto:qigong@gwmail.gwu.edu" class="">qigong@gwmail.gwu.edu</a>> wrote:</div>

<br class="Apple-interchange-newline">

<div class="">Hello everyone,<br class="">

<br class="">

We use Bioformat to extract ROI from WSI. But the color of extracted<br class="">

ROI is different from imagescope displayed ROI. We think that might be<br class="">

the icc problem.<br class="">

<br class="">

The image formats we are using are ndpi and svs. We think the icc in<br class="">

embed in the image file. We want to know<br class="">

1. Does Bioformat automatically apply the icc to the image?<br class="">

2. Is there any Bioformat function we can use to get the embed icc<br class="">

file or information?<br class="">

<br class="">

Thank you,<br class="">

Qi<br class="">

<br class="">

-- <br class="">

mobile phone: 2024060862<br class="">

_______________________________________________<br class="">

ome-users mailing list<br class="">

<a href="mailto:ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk" class="">ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk</a><br class="">

http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users<br class="">

</div>

</blockquote>

</div>

<br class="">

</div>

<br>

<span style="font-size:10pt;">The University of Dundee is a registered Scottish Charity, No: SC015096</span>

</body>

</html>