<html>

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">

</head>

<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">

Hi Zhan,

<div class=""><br class="">

</div>

<div class="">Thank you for your raising this issue, we have had similar reports previously regarding the title displayed on the image window in FIJI.</div>

<div class="">The image metadata should be correct and remain unaffected, however the title displayed at the top of the window is currently based on the filename of the last file processed.</div>

<div class=""><br class="">

</div>

<div class="">We have an existing ticket to investigate a better solution for this issue and I have added the details of this report to the ticket.</div>

<div class=""><a href="https://trac.openmicroscopy.org/ome/ticket/13306" class="">https://trac.openmicroscopy.org/ome/ticket/13306</a></div>

<div class=""><br class="">

<div class=""><br class="">

</div>

<div class="">With Thanks,</div>

<div class="">David Gault</div>

<div class=""><br class="">

<div>

<blockquote type="cite" class="">

<div class="">On 24 Mar 2017, at 09:49, zhanyinx <<a href="mailto:yinxiu.zhan@fmi.ch" class="">yinxiu.zhan@fmi.ch</a>> wrote:</div>

<br class="Apple-interchange-newline">

<div class=""><span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; float: none; display: inline !important;" class="">Dear

 all,</span>

<div class="" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;">

<br class="">

</div>

<div class="" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;">

I am experiencing a problem with the title of images imported with bio format importer in FIJI.</div>

<div class="" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;">

Whatever the .nd file I import, the bioformat importer loads the correct files but assigns the same name to all files.</div>

<div class="" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;">

<br class="">

</div>

<div class="" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;">

<br class="">

</div>

<div class="" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;">

For example, in a given directory I have the following files:</div>

<div class="" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;">

<br class="">

</div>

<div class="" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;">

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);">

<span class="" style="font-size: 11px;"><font color="#ff2600" class=""><b class="">170313_RNA_TXYDeltaA_DXpas670_Xist610_TsixFITC_15.nd</b></font></span></div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);">

<span class="" style="font-size: 11px;"><b class=""><font color="#ff2600" class="">170313_RNA_TXYDeltaA_DXpas670_Xist610_TsixFITC_15_thumb_w1Penta-FarRed.TIF</font></b></span></div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);">

<span class="" style="font-size: 11px;"><b class=""><font color="#ff2600" class="">170313_RNA_TXYDeltaA_DXpas670_Xist610_TsixFITC_15_thumb_w2Penta-Red-100.TIF</font></b></span></div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);">

<span class="" style="font-size: 11px;"><b class=""><font color="#ff2600" class="">170313_RNA_TXYDeltaA_DXpas670_Xist610_TsixFITC_15_thumb_w3Penta-Green.TIF</font></b></span></div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);">

<span class="" style="font-size: 11px;"><b class=""><font color="#ff2600" class="">170313_RNA_TXYDeltaA_DXpas670_Xist610_TsixFITC_15_thumb_w4Penta-DAPI.TIF</font></b></span></div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);">

<span class="" style="font-size: 11px;"><b class=""><font color="#ff2600" class="">170313_RNA_TXYDeltaA_DXpas670_Xist610_TsixFITC_15_w1Penta-FarRed.TIF</font></b></span></div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);">

<span class="" style="font-size: 11px;"><b class=""><font color="#ff2600" class="">170313_RNA_TXYDeltaA_DXpas670_Xist610_TsixFITC_15_w2Penta-Red-100.TIF</font></b></span></div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);">

<span class="" style="font-size: 11px;"><b class=""><font color="#ff2600" class="">170313_RNA_TXYDeltaA_DXpas670_Xist610_TsixFITC_15_w3Penta-Green.TIF</font></b></span></div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);">

<span class="" style="font-size: 11px;"><b class=""><font color="#ff2600" class="">170313_RNA_TXYDeltaA_DXpas670_Xist610_TsixFITC_15_w4Penta-DAPI.TIF</font></b></span></div>

</div>

<div class="" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; margin: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);">

<span class="" style="font-size: 11px;"><b class=""><font color="#ff2600" class=""><br class="">

</font></b></span></div>

<div class="" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; margin: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);">

<span class="" style="font-size: 11px;"><b class=""><font color="#ff2600" class=""><br class="">

</font></b></span></div>

<div class="" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; margin: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);">

<span class="" style="font-size: 11px;">

<div class="" style="color: rgb(255, 38, 0); font-weight: bold; margin: 0px; line-height: normal;">

<span class="">170313_RNA_TXYDeltaA_DXpas670_Xist610_TsixFITC_1.nd</span></div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;"><span class="">

<div class="" style="color: rgb(255, 38, 0); font-weight: bold; margin: 0px; line-height: normal;">

<span class="">170313_RNA_TXYDeltaA_DXpas670_Xist610_TsixFITC_1_thumb_w1Penta-FarRed.TIF</span></div>

<div class="" style="color: rgb(255, 38, 0); font-weight: bold; margin: 0px; line-height: normal;">

<span class="">170313_RNA_TXYDeltaA_DXpas670_Xist610_TsixFITC_1_thumb_w2Penta-Red-100.TIF</span></div>

<div class="" style="color: rgb(255, 38, 0); font-weight: bold; margin: 0px; line-height: normal;">

<span class="">170313_RNA_TXYDeltaA_DXpas670_Xist610_TsixFITC_1_thumb_w3Penta-Green.TIF</span></div>

<div class="" style="color: rgb(255, 38, 0); font-weight: bold; margin: 0px; line-height: normal;">

<span class="">170313_RNA_TXYDeltaA_DXpas670_Xist610_TsixFITC_1_thumb_w4Penta-DAPI.TIF</span></div>

<div class="" style="color: rgb(255, 38, 0); font-weight: bold; margin: 0px; line-height: normal;">

<span class="">170313_RNA_TXYDeltaA_DXpas670_Xist610_TsixFITC_1_w1Penta-FarRed.TIF</span></div>

<div class="" style="color: rgb(255, 38, 0); font-weight: bold; margin: 0px; line-height: normal;">

<span class="">170313_RNA_TXYDeltaA_DXpas670_Xist610_TsixFITC_1_w2Penta-Red-100.TIF</span></div>

<div class="" style="color: rgb(255, 38, 0); font-weight: bold; margin: 0px; line-height: normal;">

<span class="">170313_RNA_TXYDeltaA_DXpas670_Xist610_TsixFITC_1_w3Penta-Green.TIF</span></div>

<div class="" style="color: rgb(255, 38, 0); font-weight: bold; margin: 0px; line-height: normal;">

<span class="">170313_RNA_TXYDeltaA_DXpas670_Xist610_TsixFITC_1_w4Penta-DAPI.TIF</span></div>

<div class="" style="color: rgb(255, 38, 0); font-weight: bold; margin: 0px; line-height: normal;">

<span class=""><br class="">

</span></div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;"><span class="">

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;"><span class=""><b class=""><font color="#ff2600" class="">170313_RNA_TXY_DeltaA_Dxpas670_Xist610_Tsix3Fluoresc_1.nd</font></b></span></div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;"><span class=""><b class=""><font color="#ff2600" class="">170313_RNA_TXY_DeltaA_Dxpas670_Xist610_Tsix3Fluoresc_1_thumb_w1Penta-FarRed.TIF</font></b></span></div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;"><span class=""><b class=""><font color="#ff2600" class="">170313_RNA_TXY_DeltaA_Dxpas670_Xist610_Tsix3Fluoresc_1_thumb_w2Penta-Red.TIF</font></b></span></div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;"><span class=""><b class=""><font color="#ff2600" class="">170313_RNA_TXY_DeltaA_Dxpas670_Xist610_Tsix3Fluoresc_1_thumb_w3Penta-Green.TIF</font></b></span></div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;"><span class=""><b class=""><font color="#ff2600" class="">170313_RNA_TXY_DeltaA_Dxpas670_Xist610_Tsix3Fluoresc_1_thumb_w4Penta-DAPI.TIF</font></b></span></div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;"><span class=""><b class=""><font color="#ff2600" class="">170313_RNA_TXY_DeltaA_Dxpas670_Xist610_Tsix3Fluoresc_1_w1Penta-FarRed.TIF</font></b></span></div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;"><span class=""><b class=""><font color="#ff2600" class="">170313_RNA_TXY_DeltaA_Dxpas670_Xist610_Tsix3Fluoresc_1_w2Penta-Red.TIF</font></b></span></div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;"><span class=""><b class=""><font color="#ff2600" class="">170313_RNA_TXY_DeltaA_Dxpas670_Xist610_Tsix3Fluoresc_1_w3Penta-Green.TIF</font></b></span></div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;"><span class=""><b class=""><font color="#ff2600" class="">170313_RNA_TXY_DeltaA_Dxpas670_Xist610_Tsix3Fluoresc_1_w4Penta-DAPI.TIF</font></b></span></div>

<div class="" style="color: rgb(195, 55, 32); font-weight: normal; margin: 0px; line-height: normal; font-family: Menlo;">

<span class=""><b class=""><br class="">

</b></span></div>

</span></div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;">and other .nd files with the corresponding TIF files.</div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;"><br class="">

</div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;">Whatever files I open, the name is always</div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;"><b class=""><font color="#ff2600" class="">170313_RNA_TXY_DeltaA_Dxpas670_Xist610_Tsix3Fluoresc_1_thumb_w1Penta-FarRed.TIF</font></b></div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;"><br class="">

</div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;">System I am using:</div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;">Mac OS Sierra</div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;">ImageJ 2.0.0-rc-59/1.51k</div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;">Java version: <span class="" style="font-family: Menlo;">"1.6.0_65"</span></div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;">Bio-format importer updated to the last version</div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;"><br class="">

</div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;"><br class="">

</div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;">Attached you can find an example of .nd file</div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;"><br class="">

</div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;"><br class="">

</div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;">Thanks for your attention,</div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;">Best</div>

<div class="" style="margin: 0px; line-height: normal;">Zhan</div>

</span></div>

</span></div>

</div>

</blockquote>

</div>

<br class="">

</div>

</div>

<br>

<span style="font-size:10pt;">The University of Dundee is a registered Scottish Charity, No: SC015096</span>

</body>

</html>