<div dir="ltr"><div>Hello Josh,</div><div><br></div><div>1. As attachment, I think the version is 5.2.7</div><div><br></div><div>2. I use the "-db" command it still has the same problem. I didn't remember I set ICE_CONFIG. I only set config following instruction. </div><div>"<span style="background-color:rgb(241,241,241);color:rgb(0,0,0);font-family:consolas,"deja vu sans mono","bitstream vera sans mono",monospace;font-size:14px;letter-spacing:0.015em">C:\OMERO.server\> bin\omero config set <a href="http://omero.db.name">omero.db.name</a> omero_database</span></div><pre style="overflow-x:auto;overflow-y:hidden;font-family:consolas,"deja vu sans mono","bitstream vera sans mono",monospace;font-size:14px;letter-spacing:0.015em;line-height:16.8px;padding:0.5em;border:1px solid rgb(204,204,204);background-color:rgb(241,241,241);max-width:60em;color:rgb(0,0,0)">C:\OMERO.server\> bin\omero config set omero.db.user db_user
C:\OMERO.server\> bin\omero config set omero.db.pass db_password"</pre><div>3. This is the Path for System variable (not user variable)</div>C:\Program Files (x86)\AMD APP\bin\x86_64;C:\Program Files (x86)\AMD APP\bin\x86;<b><font size="4">C:\Program Files\Java\jdk1.8.0_65\bin;C:\ProgramData\Oracle\Java\javapath;</font></b>C:\Program Files (x86)\NVIDIA Corporation\PhysX\Common;C:\Windows\system32;C:\Windows;C:\Windows\System32\Wbem;C:\Windows\System32\WindowsPowerShell\v1.0\;C:\Program Files (x86)\Aperio\Common;C:\Program Files (x86)\Point Grey Research\PGR FlyCapture\bin64\;C:\Program Files\TortoiseSVN\bin;C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\miktex\bin\;C:\Program Files\MATLAB\R2016a\runtime\win64;C:\Program Files\MATLAB\R2016a\bin;C:\Program Files (x86)\MATLAB\R2013a\runtime\win32;C:\Program Files (x86)\MATLAB\R2013a\bin;C:\Program Files\MATLAB\MATLAB Compiler Runtime\v715\runtime\win64;C:\Program Files\TortoiseGit\bin;C:\Program Files (x86)\Git\cmd;C:\Program Files (x86)\ATI Technologies\ATI.ACE\Core-Static;C:\Program Files\Point Grey Research\FlyCapture2\bin64;C:\Program Files\MATLAB\MATLAB Runtime\v901\runtime\win64;C:\Ice-3.5.1-b4-win-x64-Release\bin;C:\Python27<br><div><br></div><div>Does this correct? Thank you.</div><div><br></div><div>Regards,</div><div>Qi</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Feb 27, 2017 at 11:18 AM, Josh Moore <span dir="ltr"><<a href="mailto:josh@glencoesoftware.com" target="_blank">josh@glencoesoftware.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">On Mon, Feb 27, 2017 at 4:54 PM, Qi Gong <<a href="mailto:qigong@gwmail.gwu.edu">qigong@gwmail.gwu.edu</a>> wrote:<br>
> Hello Josh,<br>
<br>
Hi Qi,<br>
<span class=""><br>
<br>
> 1. At first I downloaded and installed the 5.3 version OMERO server, I found<br>
> the problem and reinstall 5.2.7 version. But in the cmd.png attachment blue<br>
> square, there are warning about 5.3 version, do you know how to check the<br>
> version?<br>
<br>
</span>You can use:<br>
<br>
   bin\omero version<br>
<br>
to see which version you are using. We added the warning in the 5.2<br>
line to make sure that everyone was aware.<br>
<span class=""><br>
<br>
><br>
> 2. Follow the instruction, I create database in pgAdmin4. As pgAdmin4.png<br>
> attachment, I set database, login role and password to "testOmero". In the<br>
> cmd.png attachment blue square, what command should I use to initialize<br>
> database? "bin\omero db script --password testOmero" or  "bin\omero db<br>
> script --password root_password"?<br>
<br>
</span>You want:<br>
<br>
  --password testOmero<br>
<br>
The documentation uses "root_password" as an example.<br>
<span class=""><br>
<br>
> 3. In the same square(blue), I face AttributeError? Did you face similar<br>
> error before?<br>
<br>
</span>This error is unexpected. Have you set ICE_CONFIG perhaps? If not,<br>
could you try running this command with -d1:<br>
<br>
  bin\omero -d1 db script --password testOmero<br>
<span class=""><br>
<br>
> 4. In cmd.png attachment, the red square shows I have java installed. But in<br>
> the green square, It says Java could not be found.<br>
<br>
</span>This looks like the environment setting is not propagating to<br>
subprocesses. Is the Java installation new or have you used it<br>
previously? In which %PATH% variable is it defined?<br>
<br>
Cheers,<br>
~Josh.<br>
<div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
<br>
> Thank you very much for your time and help.<br>
><br>
> Regards,<br>
> Qi<br>
><br>
><br>
> On Mon, Feb 27, 2017 at 6:26 AM, Josh Moore <<a href="mailto:josh@glencoesoftware.com">josh@glencoesoftware.com</a>><br>
> wrote:<br>
>><br>
>> Hi Qi,<br>
>><br>
>><br>
>> On Fri, Feb 24, 2017 at 8:31 PM, Qi Gong <<a href="mailto:qigong@gwmail.gwu.edu">qigong@gwmail.gwu.edu</a>> wrote:<br>
>> > Hello William,<br>
>> ><br>
>> > I tried to install a OMERO server on my local computer follow:<br>
>> ><br>
>> > <a href="https://www.openmicroscopy.org/site/support/omero5.2/sysadmins/windows/server-installation.html" rel="noreferrer" target="_blank">https://www.openmicroscopy.<wbr>org/site/support/omero5.2/<wbr>sysadmins/windows/server-<wbr>installation.html</a><br>
>><br>
>> Just in case you hadn't seen it, Windows support will be ending with<br>
>> the 5.2 version. OMERO 5.3 which is intended for release next month<br>
>> has _not_ been tested on Windows. See<br>
>><br>
>> <a href="http://blog.openmicroscopy.org/tech-issues/future-plans/deployment/2016/03/22/windows-support/" rel="noreferrer" target="_blank">http://blog.openmicroscopy.<wbr>org/tech-issues/future-plans/<wbr>deployment/2016/03/22/windows-<wbr>support/</a><br>
>> for more information.<br>
>><br>
>> If you'd like to try using Docker or VirtualBox to run a Linux-image<br>
>> on Windows, please let us know.<br>
>><br>
>><br>
>> > But I am facing some problem and have some questions.<br>
>> > 1. May I skip this command? C:\OMERO.server> bin\omero db script<br>
>> > --password<br>
>> > root_password?<br>
>><br>
>> No. This generates the PostgreSQL script which will initialize your<br>
>> database.<br>
>><br>
>><br>
>> > 2. I am sure we have Java installed, but when I enter command:<br>
>> > bin\omero<br>
>> > admin start, system says Java could not be found.<br>
>> ><br>
>> > I attach a screenshot of cmd window. Have you ever faced similar problem<br>
>> > before? Thank you.<br>
>><br>
>> Is Java set on the system PATH like the variables for Ice & Python<br>
>> from<br>
>> <a href="https://www.openmicroscopy.org/site/support/omero5.2/sysadmins/windows/server-installation.html#environment-variables" rel="noreferrer" target="_blank">https://www.openmicroscopy.<wbr>org/site/support/omero5.2/<wbr>sysadmins/windows/server-<wbr>installation.html#environment-<wbr>variables</a><br>
>> ?<br>
>><br>
>> Cheers,<br>
>> ~Josh<br>
>><br>
>><br>
>> > Regards,<br>
>> > Qi<br>
>> ><br>
>> ><br>
>> > On Wed, Feb 1, 2017 at 6:07 AM, William Moore (Staff)<br>
>> > <<a href="mailto:W.Moore@dundee.ac.uk">W.Moore@dundee.ac.uk</a>><br>
>> > wrote:<br>
>> >><br>
>> >> Hi Qi,<br>
>> >><br>
>> >>  I’m afraid that you do need to install and run an OMERO server.<br>
>> >><br>
>> >> You might want to sign up for an account on our “demo” server that will<br>
>> >> allow you<br>
>> >> to import some data and get started with OMERO.<br>
>> >> Although this should not be used as a repository for any important<br>
>> >> data.<br>
>> >><br>
>> >>  See<br>
>> >><br>
>> >> <a href="https://www.openmicroscopy.org/site/support/omero5.2/users/demo-server.html" rel="noreferrer" target="_blank">https://www.openmicroscopy.<wbr>org/site/support/omero5.2/<wbr>users/demo-server.html</a><br>
>> >> for details.<br>
>> >><br>
>> >> Regards,<br>
>> >><br>
>> >>   Will.<br>
>> >><br>
>> >><br>
>> >><br>
>> >> On 31 Jan 2017, at 20:27, Qi Gong <<a href="mailto:qigong@gwmail.gwu.edu">qigong@gwmail.gwu.edu</a>> wrote:<br>
>> >><br>
>> >> Hello Kenneth,<br>
>> >><br>
>> >> We want to use OMERO to view WSI images on our computer. Do we need to<br>
>> >> install and run a server or is there a stand alone browser? Thank you.<br>
>> >><br>
>> >> Regards,<br>
>> >> Qi<br>
>> >><br>
>> >> On Thu, Jan 26, 2017 at 4:14 PM, Kenneth Gillen (Staff)<br>
>> >> <<a href="mailto:k.h.gillen@dundee.ac.uk">k.h.gillen@dundee.ac.uk</a>> wrote:<br>
>> >>><br>
>> >>> Hi Qi,<br>
>> >>><br>
>> >>> Generally you’d be given these by someone at your institution or<br>
>> >>> organisation. Your local IT support may also be able to suggest<br>
>> >>> something.<br>
>> >>><br>
>> >>> Perhaps the person who suggested you use OMERO in the first place will<br>
>> >>> be<br>
>> >>> able to point you in the right direction?<br>
>> >>><br>
>> >>> All the best,<br>
>> >>><br>
>> >>> Kenny<br>
>> ______________________________<wbr>_________________<br>
>> ome-users mailing list<br>
>> <a href="mailto:ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk">ome-users@lists.<wbr>openmicroscopy.org.uk</a><br>
>> <a href="http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.openmicroscopy.<wbr>org.uk/mailman/listinfo/ome-<wbr>users</a><br>
><br>
><br>
><br>
><br>
> --<br>
> mobile phone: <a href="tel:2024060862" value="+12024060862">2024060862</a><br>
><br>
> ______________________________<wbr>_________________<br>
> ome-users mailing list<br>
> <a href="mailto:ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk">ome-users@lists.<wbr>openmicroscopy.org.uk</a><br>
> <a href="http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.openmicroscopy.<wbr>org.uk/mailman/listinfo/ome-<wbr>users</a><br>
><br>
______________________________<wbr>_________________<br>
ome-users mailing list<br>
<a href="mailto:ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk">ome-users@lists.<wbr>openmicroscopy.org.uk</a><br>
<a href="http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.openmicroscopy.<wbr>org.uk/mailman/listinfo/ome-<wbr>users</a><br>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature">mobile phone: 2024060862</div>
</div>