<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; color: rgb(0, 0, 0); font-size: 14px;">
<div>
<div style="font-family: Calibri, sans-serif;">Hi,</div>
<div style="font-family: Calibri, sans-serif;"><br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, sans-serif;">Thank you for reporting your issue.</div>
<div style="font-family: Calibri, sans-serif;"><br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, sans-serif;">We are aware of the problems with the data from the Elyra systems, and a ticket has already been filed on this regard,</div>
<div style="font-family: Calibri, sans-serif;"><a href="https://trac.openmicroscopy.org/ome/ticket/12469">https://trac.openmicroscopy.org/ome/ticket/12469</a></div>
<div style="font-family: Calibri, sans-serif;"><br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, sans-serif;">This will get looked into at the earliest. Please let us know if you would like us to add you to the cc list, in the ticket. </div>
<div style="font-family: Calibri, sans-serif;"><br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, sans-serif;">Reg the warning lines:</div>
<div>
<pre style="white-space: pre-wrap; background-color: rgb(255, 255, 255);"><font face="Calibri">An explanation has been posted in the following thread,</font></pre>
<pre style="white-space: pre-wrap; background-color: rgb(255, 255, 255);"><span style="font-family: Calibri;"><a href="http://lists.openmicroscopy.org.uk/pipermail/ome-users/2017-January/006312.html">http://lists.openmicroscopy.org.uk/pipermail/ome-users/2017-January/006312.html</a></span></pre>
<pre style="white-space: pre-wrap;"><span style="font-family: Calibri; background-color: rgb(255, 254, 254);">Hope that helps.</span></pre>
<pre style="white-space: pre-wrap;"><span style="font-family: Calibri; background-color: rgb(254, 253, 253);">Best,</span></pre>
<pre style="white-space: pre-wrap;"><span style="font-family: Calibri; background-color: rgb(253, 252, 252);">Balaji</span></pre>
</div>
<div>
<div><br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, sans-serif;">
<div style="color: rgb(40, 40, 40);"><span style="background-color: rgb(255, 255, 255);">__________________</span></div>
<div style="color: rgb(40, 40, 40);">
<p style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;">Mr Balaji Ramalingam</p>
<p style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;">Software Developer<br>
</p>
<p style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;">OME Team</p>
<p style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;">School of Life Sciences</p>
<p style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;">University of Dundee</p>
</div>
</div>
</div>
</div>
<div style="font-family: Calibri, sans-serif;"><br>
</div>
<span id="OLK_SRC_BODY_SECTION" style="font-family: Calibri, sans-serif;">
<div style="font-family:Calibri; font-size:11pt; text-align:left; color:black; BORDER-BOTTOM: medium none; BORDER-LEFT: medium none; PADDING-BOTTOM: 0in; PADDING-LEFT: 0in; PADDING-RIGHT: 0in; BORDER-TOP: #b5c4df 1pt solid; BORDER-RIGHT: medium none; PADDING-TOP: 3pt">
<span style="font-weight:bold">From: </span>ome-users <<a href="mailto:ome-users-bounces@lists.openmicroscopy.org.uk">ome-users-bounces@lists.openmicroscopy.org.uk</a>> on behalf of "Bruckbauer, Andreas" <<a href="mailto:a.bruckbauer@imperial.ac.uk">a.bruckbauer@imperial.ac.uk</a>><br>
<span style="font-weight:bold">Reply-To: </span>OME User Support List <<a href="mailto:ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk">ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk</a>><br>
<span style="font-weight:bold">Date: </span>Monday, 13 February 2017 at 13:10<br>
<span style="font-weight:bold">To: </span>OME User Support List <<a href="mailto:ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk">ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk</a>><br>
<span style="font-weight:bold">Subject: </span>[ome-users] problem opening Elyra CZI file<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">
<meta name="Generator" content="Microsoft Word 15 (filtered medium)">
<style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri",sans-serif;
        mso-fareast-language:EN-US;}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:#0563C1;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:#954F72;
        text-decoration:underline;}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal-compose;
        font-family:"Calibri",sans-serif;
        color:windowtext;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;
        font-family:"Calibri",sans-serif;
        mso-fareast-language:EN-US;}
@page WordSection1
        {size:612.0pt 792.0pt;
        margin:72.0pt 72.0pt 72.0pt 72.0pt;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]-->
<div lang="EN-GB" link="#0563C1" vlink="#954F72">
<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal">Hello,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">I have problems opening a CZI file which was generated on an Elyra microscope. It should be a two channel time series with 3000 time points, but I get only a single frame (two channels).
<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">There are no error messages, just a few warnings:<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">[WARN] Unknown DetectorType value 'Camera' will be stored as "Other"<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">[WARN] Unknown DetectorType value 'Camera' will be stored as "Other"<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">[WARN] Unknown DetectorType value 'Camera' will be stored as "Other"<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">I have just uploaded the file.<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Best wishes<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Andreas<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal" style="background:white"><span style="font-size:12.0pt;color:black;mso-fareast-language:EN-GB">----------------------------------------------------<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="background:white"><span style="color:black;mso-fareast-language:EN-GB">Dr Andreas Bruckbauer<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="background:white"><span style="color:black;mso-fareast-language:EN-GB">FILM facility manager<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="background:white"><span style="color:black;mso-fareast-language:EN-GB"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="background:white"><span style="color:black;mso-fareast-language:EN-GB">Sir Alexander Fleming Building<br>
South Kensington Campus<br>
Imperial College London<br>
Exhibition Road<br>
London, SW7 2AZ<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="background:white"><span style="color:black;mso-fareast-language:EN-GB"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="background:white"><span style="color:black;mso-fareast-language:EN-GB">SAF 4th floor, open space desk 401<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="background:white"><span style="color:black;mso-fareast-language:EN-GB">+44 (0)20 7594 2023<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="background:white"><span style="color:black;mso-fareast-language:EN-GB"><a href="mailto:a.bruckbauer@imperial.ac.uk"><span style="color:#0563C1">a.bruckbauer@imperial.ac.uk</span></a><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="background:white"><span style="color:black;mso-fareast-language:EN-GB"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="background:white"><span style="color:black;mso-fareast-language:EN-GB"><a href="http://www.imperial.ac.uk/medicine/facility-for-imaging-by-light-microscopy/"><span style="color:#0563C1">http://www.imperial.ac.uk/medicine/facility-for-imaging-by-light-microscopy/</span></a><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="background:white"><span style="color:black;mso-fareast-language:EN-GB">----------------------------------------------------<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
</div>
</div>
</span><br>
<span style="font-size:10pt;">The University of Dundee is a registered Scottish Charity, No: SC015096</span>
</body>
</html>