<div dir="ltr"><div>Hello all, good afternoon,</div><div><br></div><div>I am Minh Doan, a postdoc in imaging platform of Broad Institute. I'm working on a project that uses Amnis FlowSight .cif , which could be opened by Bioformats (MATLAB version and python-bioformats)</div><div><br></div><div>Unfortunately the resolution of the image after being opened by both of the versions are lossy. Can anyone so kind to help me check this out.</div><div><br></div><div>I send here 2 screenshots, one that compares between image opened by python-bioformats and its original form (export directly from Amnis IDEAS). And the other screenshot compare image opened by MATLAB-bioformats package, compared with its original form</div><div><br></div><div>I also attach an example .cif file.</div><div><br></div><div>Any advices are very much appreciated.</div><div><br></div><div>Bests,</div><div>Minh</div><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"><div style="font-size:12.8px"><div style="font-size:12.8px"><div style="font-size:12.8px"><span style="color:rgb(102,102,102);font-family:arial;font-size:small">Minh Doan, M.D., Ph.D.</span></div></div></div><div style="font-size:12.8px"><div style="font-size:12.8px"><div style="font-size:12.8px"><font color="#666666"><span style="font-family:arial;font-size:small">Imaging Platform</span></font></div></div></div><div style="font-size:12.8px"><div style="font-size:12.8px"><div style="font-size:12.8px"><font color="#666666"><span style="font-family:arial;font-size:small">Broad Institute of Harvard and MIT</span></font></div></div></div><div style="font-size:12.8px"><div style="font-size:12.8px"><div style="font-size:12.8px"><font color="#666666"><span style="font-family:arial;font-size:small">415 Main Street, </span></font></div></div></div><div style="font-size:12.8px"><div style="font-size:12.8px"><div style="font-size:12.8px"><div style="font-family:arial;font-size:small"><font color="#666666">Cambridge MA 02142</font></div></div></div></div><div style="font-size:12.8px"><div style="font-size:12.8px"><div style="font-family:arial;font-size:small"><font color="#666666">phone: (617) 714-7681</font></div></div></div><div style="font-size:12.8px"><div style="font-size:12.8px"><font size="2" color="#000000"><font style="font-family:Arial"><a href="mailto:nathalie.court@pasteur.fr" style="color:rgb(17,85,204)" target="_blank">minhdoan@broadinstitute.org</a></font></font></div></div></blockquote></div></div>
</div>