<div dir="ltr">Hello everyone,<div><br></div><div>Sorry for bother. I want to know could I use Bio-Formats read .czi format WSI image in matlab? I could read in .svs and .ndpi formats now. When I used same code to read in .czi file, matlab gave me error. Thank you very much.</div><div><br></div><div><div>>> WSI_data = bfGetReader('C:\000_whole_slides\WSIcziexample.czi');</div><div><br></div><div>Warning: *** Insufficient memory detected. ***</div><div>*** 352m found ***</div><div>*** 512m or greater is recommended ***</div><div>*** See <a href="http://www.mathworks.com/matlabcentral/answers/92813">http://www.mathworks.com/matlabcentral/answers/92813</a> ***</div><div>*** for instructions on increasing memory allocation. ***</div><div> </div><div>> In bfCheckJavaMemory (line 53)</div><div>  In bfGetReader (line 47) </div><div>Error using bfGetReader (line 85)</div><div>Java exception occurred:</div><div>loci.formats.UnsupportedCompressionException: JPEG-XR not yet supported</div><div><br></div><div><span class="" style="white-space:pre">       </span>at loci.formats.in.ZeissCZIReader$SubBlock.readPixelData(ZeissCZIReader.java:2936)</div><div><br></div><div><span class="" style="white-space:pre">        </span>at loci.formats.in.ZeissCZIReader$SubBlock.readPixelData(ZeissCZIReader.java:2908)</div><div><br></div><div><span class="" style="white-space:pre">        </span>at loci.formats.in.ZeissCZIReader.initFile(ZeissCZIReader.java:557)</div><div><br></div><div><span class="" style="white-space:pre">       </span>at loci.formats.FormatReader.setId(FormatReader.java:1426)</div><div><br></div><div><span class="" style="white-space:pre">        </span>at loci.formats.ImageReader.setId(ImageReader.java:835)</div><div><br></div><div><span class="" style="white-space:pre">   </span>at loci.formats.ReaderWrapper.setId(ReaderWrapper.java:651)</div><div><br></div><div><span class="" style="white-space:pre">       </span>at loci.formats.ChannelFiller.setId(ChannelFiller.java:223)</div><div><br></div><div><span class="" style="white-space:pre">       </span>at loci.formats.ReaderWrapper.setId(ReaderWrapper.java:651)</div><div><br></div><div><span class="" style="white-space:pre">       </span>at loci.formats.ChannelSeparator.setId(ChannelSeparator.java:289)</div><div><br></div><div>Regards,</div><div>Qi</div><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature">mobile phone: 2024060862</div>
</div></div>