<div dir="ltr"><div>Dear Bioformatters,<br><br>I wanted to store and also retrieve the preferred color mapping for image channels within OME-TIFF. Something like: channel0: 0,255,0; channel1: 255,0,0. I was looking over the schema and didn't find a specific field for this. Also looking at the OME-TIFF file produced by converting from a proprietary file this information seems not to be stored nor red by the viewer (bioformats or imagej). I'm not sure if I'm being unlucky with the format though.<br><br>My question would be if there's such a field somewhere, say in channel:<br><Channel ID="Channel:0:0" Name="FITC" SamplesPerPixel="1"><br><DetectorSettings ID="Detector:0:0"/><br><ColorMapping Value="255,0,0"/><br></Channel><br><br>I guess I could use StructuredAnnotations but those would not be interpretable by other viewers. I could also reorder channels but that would only solve mapping to a single channel but not to multiple, like yellow for example.<br><br>Thank you for your time!<br>-dmitry-- <br><div class="gmail_signature">__________________________________<br><br>Dmitry Fedorov Levit <<a href="mailto:dima@dimin.net" target="_blank">dima@dimin.net</a>><br>Web: <a href="http://www.dimin.net/" target="_blank">http://www.dimin.net/</a><br>__________________________________<br><br>Center for Bio-Image Informatics:<br>  <<a href="http://www.bioimage.ucsb.edu/" target="_blank">http://www.bioimage.ucsb.edu/</a>><br><br>Vision Research Lab, Electrical and Computer Engineering:<br>  <<a href="http://vision.ece.ucsb.edu/" target="_blank">http://vision.ece.ucsb.edu/</a>><br><br>University of California, Santa Barbara<br>_________________________________</div>
</div></div>