<div dir="ltr">Hi guys,<div><br></div><div>here is a CZI image: <a href="https://dl.dropboxusercontent.com/u/623476/AxioScan_Test.czi">https://dl.dropboxusercontent.com/u/623476/AxioScan_Test.czi</a></div><div><br></div><div>In ZEN it looks like this:</div><div><br></div><div><img src="cid:ii_14ce1be01b186b39" alt="Inline-Bild 2" width="544" height="378"><br></div><div><br></div><div><img src="cid:ii_14ce1be78daf7bfb" alt="Inline-Bild 3" width="544" height="389"><br></div><div><br></div><div><div>When I try to open this uncompressed CZI with my newest Fiji with BioFormats</div><div><br></div><div><img src="cid:ii_14ce1bc02a408049" alt="Inline-Bild 1" width="544" height="36"></div></div><div><br></div><div>This used to work so we are really interest in solving the problem. let me know, if you need help</div><div><br></div><div>Attached you can find the Information about Fiji and the system.<br></div><div><br></div><div>I get the following error message:</div><div><br></div><div><div><b>(Fiji Is Just) ImageJ 2.0.0-rc-29/1.49r; Java 1.6.0_24 [64-bit]; Windows 7 6.1; 191MB of 6127MB (3%)</b></div><div><b> </b></div><div><b>java.lang.ArrayIndexOutOfBoundsException</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre">  </span>at java.lang.System.arraycopy(Native Method)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre">    </span>at loci.formats.in.ZeissCZIReader.openBytes(ZeissCZIReader.java:361)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre">    </span>at loci.formats.ChannelFiller.openBytes(ChannelFiller.java:156)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre"> </span>at loci.formats.ChannelFiller.openBytes(ChannelFiller.java:148)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre"> </span>at loci.formats.ChannelSeparator.openBytes(ChannelSeparator.java:196)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre">   </span>at loci.formats.ReaderWrapper.openBytes(ReaderWrapper.java:349)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre"> </span>at loci.formats.DimensionSwapper.openBytes(DimensionSwapper.java:249)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre">   </span>at loci.formats.ReaderWrapper.openBytes(ReaderWrapper.java:349)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre"> </span>at loci.formats.MinMaxCalculator.openBytes(MinMaxCalculator.java:269)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre">   </span>at loci.formats.MinMaxCalculator.openBytes(MinMaxCalculator.java:260)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre">   </span>at loci.formats.ReaderWrapper.openBytes(ReaderWrapper.java:335)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre"> </span>at loci.formats.ReaderWrapper.openBytes(ReaderWrapper.java:335)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre"> </span>at loci.plugins.util.ImageProcessorReader.openProcessors(ImageProcessorReader.java:186)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre"> </span>at loci.plugins.in.ImagePlusReader.readProcessors(ImagePlusReader.java:416)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre">     </span>at loci.plugins.in.ImagePlusReader.readPlanes(ImagePlusReader.java:380)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre"> </span>at loci.plugins.in.ImagePlusReader.readImage(ImagePlusReader.java:277)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre">  </span>at loci.plugins.in.ImagePlusReader.readImages(ImagePlusReader.java:238)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre"> </span>at loci.plugins.in.ImagePlusReader.readImages(ImagePlusReader.java:216)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre"> </span>at loci.plugins.in.ImagePlusReader.openImagePlus(ImagePlusReader.java:111)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre">      </span>at loci.plugins.in.Importer.readPixels(Importer.java:146)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre">       </span>at loci.plugins.in.Importer.run(Importer.java:85)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre">       </span>at loci.plugins.LociImporter.run(LociImporter.java:78)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre">  </span>at ij.IJ.runUserPlugIn(IJ.java:199)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre">     </span>at ij.IJ.runPlugIn(IJ.java:163)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre"> </span>at ij.IJ.runPlugIn(IJ.java:152)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre"> </span>at HandleExtraFileTypes.openImage(HandleExtraFileTypes.java:450)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre">        </span>at HandleExtraFileTypes.run(HandleExtraFileTypes.java:66)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre">       </span>at ij.IJ.runUserPlugIn(IJ.java:199)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre">     </span>at ij.IJ.runPlugIn(IJ.java:163)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre"> </span>at ij.IJ.runPlugIn(IJ.java:152)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre"> </span>at ij.io.Opener.openWithHandleExtraFileTypes(Opener.java:486)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre">   </span>at ij.io.Opener.openImage(Opener.java:360)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre">      </span>at ij.io.Opener.openImage(Opener.java:239)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre">      </span>at ij.io.Opener.open(Opener.java:106)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre">   </span>at ij.io.Opener.openAndAddToRecent(Opener.java:288)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre">     </span>at ij.plugin.DragAndDrop.openFile(DragAndDrop.java:176)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre"> </span>at ij.plugin.DragAndDrop.run(DragAndDrop.java:152)</b></div><div><b><span class="" style="white-space:pre">      </span>at java.lang.Thread.run(Thread.java:662)</b></div></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div><div><br></div>
</div></div>