<div dir="ltr">Hi,<div><br></div><div>here you can find 2 CZI sample data sets:</div><div><br></div><div><a href="https://dl.dropboxusercontent.com/u/623476/XYCZT_CH%3D2_Z%3D5_All_CH_per_Slice.czi">https://dl.dropboxusercontent.com/u/623476/XYCZT_CH%3D2_Z%3D5_All_CH_per_Slice.czi</a><br></div><div><br></div><div><a href="https://dl.dropboxusercontent.com/u/623476/XYZCT_Z%3D5_CH%3D2_Z%3D5_FullStack_per_CH.czi">https://dl.dropboxusercontent.com/u/623476/XYZCT_Z%3D5_CH%3D2_Z%3D5_FullStack_per_CH.czi</a><br></div><div><br></div><div>The 1st CZI file was acquired with the option "All Channels per Slice" --> XYCZT</div><div><br></div><div>The 2nd  CZI file was acquired with the option "Full Stack per Channel" --> XYZCT</div><div><br></div><div><b>When I open both files via BioFormats the original Metadata show:</b></div><div><b><br></b></div><div><b>"All Channel per Slice" --> DimensenOrder = XYCZT -- > OK</b></div><div><b>"Full Stack per Channel" --> DimensionOrder = XYCZT --> NOK</b></div><div><b><br></b></div><div>The DimensionOrder seems to be always XYCZT, no matter what it actaully was.</div><div><br></div><div>Inside the CZI File the "officail" dimension order is:</div><div><br></div><div>"All Channel per Slice" --> <b>BTCZYX0</b> --> corresponds to XYZCT</div><div>"Full Stack per Channel" --> <b>BTCZYX0</b> --> corresponds to XYZCT</div><div><br></div><div>Would be nice to get this fixed soon ...</div><div><br></div><div>Cheers</div><div><br></div><div>Sebi</div><div><br></div><div><br></div><div><br clear="all"><div><br></div><div class="gmail_signature"><br></div>
</div></div>