<div dir="ltr">Hi everyone,<div><br></div><div><div>> Importing nd2 files (two) delivers one (3-channel) image less than the</div><div>> NIS Elements Viewer.</div></div><div><br></div><div>For the archives: this report emerged from a related thread on the ImageJ mailing list, which you can find at:</div>

<div><a href="https://list.nih.gov/cgi-bin/wa.exe?A2=IMAGEJ;cc9bcbc2.1407">https://list.nih.gov/cgi-bin/wa.exe?A2=IMAGEJ;cc9bcbc2.1407</a><br></div><div><br></div><div>Regards,</div><div>Curtis</div></div><div class="gmail_extra">

<br><br><div class="gmail_quote">On Mon, Jul 14, 2014 at 3:25 PM, Karsten <span dir="ltr"><<a href="mailto:karo13de@googlemail.com" target="_blank">karo13de@googlemail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">

<br>
Importing nd2 files (two) delivers one (3-channel) image less than the NIS Elements Viewer.<br>
<br>
This happens under ImageJ, Fiji and the commandline tool showinf.<br>
<br>
The meta data show the reduced number of images, still the list of the scanning table coordinates show the full number of images extended by a constant dummy coordinate to the number of (1-channel) images found from bioformats software.<br>


<br>
I attache the output of showinf.<br>
<br>
The second file delivers also one image less than the Nikon Viewer. Additionally the metadata show a different structure by dividing the list of images in a large number of series. According the microscope users, they did not change anything saving the second data file.<br>


<br>
One image less is possibly not so important. However for the sake of correctness it could be improved.<br>
<br>
Thanks in advance for any help<br>
<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
Karsten<br>
<a href="mailto:karo13de@googlemail.com">karo13de@googlemail.com</a><br>
<br>
<br>
</font></span><br>_______________________________________________<br>
ome-users mailing list<br>
<a href="mailto:ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk">ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk</a><br>
<a href="http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users" target="_blank">http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>