<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=us-ascii"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Hi David,<div><br></div><div> Thanks for your feedback, you can upload example files at <a href="http://qa.openmicroscopy.org.uk/qa/upload/">http://qa.openmicroscopy.org.uk/qa/upload/</a></div><div>We'll have a look and get back to you,</div><div><br></div><div> Regards,</div><div><br></div><div>  Will.</div><div><br></div><div><br></div><div><div><div>On 21 Apr 2014, at 21:34, "Knecht, David" <<a href="mailto:david.knecht@uconn.edu">david.knecht@uconn.edu</a>> wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite">

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">

<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">
I tried to import a Nikon nd2 file today using Bioformats.  This normally works, and works for other files, but this data is a line scan z series and somehow the data must be saved in a different way as it does not open correctly in Fiji/ImageJ.  The image
 comes through as a stack of 3 images rather than a single image and the pixel values and locations are wrong. I can send a sample nd2 file.  Dave
<div><br>
<div apple-content-edited="true"><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; border-spacing: 0px; ">
<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">
<span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; border-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-stroke-width: 0px; ">
<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">
<span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; border-spacing: 0px; font-family: Courier; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; -webkit-text-decorations-in-effect: none; text-indent: 0px; text-transform: none; orphans: 2; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; ">
<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">
<span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; border-spacing: 0px; font-family: Courier; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; -webkit-text-decorations-in-effect: none; text-indent: 0px; text-transform: none; orphans: 2; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; border-spacing: 0px; font-family: Courier; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; -webkit-text-decorations-in-effect: none; text-indent: 0px; text-transform: none; orphans: 2; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; ">David
 Knecht, Ph.D.    </span></span></div>
</span></div>
</span><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; border-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-stroke-width: 0px; ">
<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">
<span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; border-spacing: 0px; font-family: Courier; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; -webkit-text-decorations-in-effect: none; text-indent: 0px; text-transform: none; orphans: 2; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; ">
<div>Professor and Head of Core Microscopy Facility</div>
<div>Department of Molecular and Cell Biology</div>
<div>U-3125</div>
<div>91 N. Eagleville Rd.</div>
<div>University of Connecticut</div>
<div>Storrs, CT 06269</div>
<div>860-486-2200</div>
<div>860-486-4331 (fax)</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
</span></div>
</span><br class="Apple-interchange-newline">
</div>
</span><br class="Apple-interchange-newline">
<br class="Apple-interchange-newline">
</div>
<br>
</div>
</div>

_______________________________________________<br>ome-users mailing list<br><a href="mailto:ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk">ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk</a><br>http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users<br></blockquote></div><br></div></body></html>