<div dir="ltr">Hi Mario,<div><br></div><div><div>> I get an error that the jai libraries would be missing. I checked my</div><div>> installation of Fiji (fully up-to-date and no local modifications or</div><div>> extras) and it brings jai_imageio-1.0.1.jar. Am I doing something</div>


<div>> wrong?</div></div><div><br></div><div>Nope, it was a problem introduced in the Fiji distribution recently.</div><div><br></div><div>Short answer: I believe I have fixed it. Please try updating again and let me know if it works now.</div>


<div><br></div><div>Long answer: Fiji now ships both SCIFIO (<a href="http://scif.io/" target="_blank">http://scif.io/</a>) and Bio-Formats. Each library has its own version of jai_imageio. Both are forks of the official jai_imageio. Bio-Formats's fork does *not* shade (i.e., rename) the packages; SCIFIO's does. Hence, both can be coexist in the same JVM (but not with the official version). Until just now, the SCIFIO version (i.e., jai_imageio-1.0.1.jar) was "overwriting" the Bio-Formats one, so both were not being shipped. I have remedied it by moving the Bio-Formats version into the "jars/bio-formats" subfolder.</div>


<div><br></div><div>Regards,</div><div>Curtis</div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Tue, Sep 10, 2013 at 4:59 AM, Mario Emmenlauer <span dir="ltr"><<a href="mailto:mario@emmenlauer.de" target="_blank">mario@emmenlauer.de</a>></span> wrote:<br>


<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><br>
Dear Bio-Formats Developers,<br>
<br>
I'm not sure if this is an issue with Bio-Formats or with Fiji,<br>
can you please advise me whether to forward to the correct list?<br>
<br>
The following image fails to open for me, and I get an error that<br>
the jai libraries would be missing. I checked my installation of<br>
Fiji (fully up-to-date and no local modifications or extras) and it<br>
brings jai_imageio-1.0.1.jar. Am I doing something wrong?<br>
<br>
    <a href="http://data.marssoft.de/bCB01-1D08B_wA01_s6_z1_t1_cDAPI_u1.jp2" target="_blank">http://data.marssoft.de/bCB01-1D08B_wA01_s6_z1_t1_cDAPI_u1.jp2</a><br>
<br>
Thanks and all the best,<br>
<br>
    Mario<br>
<span><font color="#888888"><br>
<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
--<br>
Mario Emmenlauer, Dipl.Inf.                  Office: <a href="tel:%2B41-%280%2961-26-72110" value="+41612672110" target="_blank">+41-(0)61-26-72110</a><br>
Biozentrum Basel<br>
Klingelbergstrasse 50/70           mailto: mario.emmenlauer * <a href="http://unibas.ch" target="_blank">unibas.ch</a><br>
CH-4056 Basel                     <a href="http://infectx.org/about_us/emmenlau/" target="_blank">http://infectx.org/about_us/emmenlau/</a><br>
<br>
<br>
<br>
_______________________________________________<br>
ome-users mailing list<br>
<a href="mailto:ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk" target="_blank">ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk</a><br>
<a href="http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users" target="_blank">http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users</a><br>
</font></span></blockquote></div><br></div></div>