<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
<meta name="Generator" content="Microsoft Word 12 (filtered medium)">
<style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Kalinga;
        panose-1:2 11 5 2 4 2 4 2 2 3;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri","sans-serif";}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:blue;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:purple;
        text-decoration:underline;}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal-compose;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        color:windowtext;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;}
@page WordSection1
        {size:8.5in 11.0in;
        margin:1.0in 1.0in 1.0in 1.0in;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]-->
</head>
<body lang="EN-US" link="blue" vlink="purple">
<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal">We just uploaded a file to your server via ftp that will not open using Loci in ImageJ.  The error messages are below.  Help woith this would be appreciated.<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Thank you,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Michael<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Drag & drop file error:<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">java.lang.NegativeArraySizeException<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at ij.io.ImageReader.read8bitImage(ImageReader.java:47)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at ij.io.ImageReader.readPixels(ImageReader.java:768)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at LSM_Reader.readStack(LSM_Reader.java:682)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at LSM_Reader.open(LSM_Reader.java:551)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at LSM_Reader.open(LSM_Reader.java:139)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at LSM_Reader.open(LSM_Reader.java:111)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at LSM_Reader.run(LSM_Reader.java:95)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at ij.IJ.runUserPlugIn(IJ.java:193)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at ij.IJ.runPlugIn(IJ.java:160)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at ij.IJ.runPlugIn(IJ.java:149)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at HandleExtraFileTypes.tryPlugIn(HandleExtraFileTypes.java:272)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at HandleExtraFileTypes.tryOpen(HandleExtraFileTypes.java:152)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at HandleExtraFileTypes.openImage(HandleExtraFileTypes.java:236)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at HandleExtraFileTypes.run(HandleExtraFileTypes.java:37)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at ij.IJ.runUserPlugIn(IJ.java:193)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at ij.IJ.runPlugIn(IJ.java:160)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at ij.IJ.runPlugIn(IJ.java:149)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at ij.io.Opener.openWithHandleExtraFileTypes(Opener.java:434)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at ij.io.Opener.openImage(Opener.java:306)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at ij.io.Opener.openImage(Opener.java:329)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at ij.io.Opener.open(Opener.java:142)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at ij.io.Opener.openAndAddToRecent(Opener.java:242)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at ij.plugin.DragAndDrop.openFile(DragAndDrop.java:176)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at ij.plugin.DragAndDrop.run(DragAndDrop.java:152)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at java.lang.Thread.run(Unknown Source)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Open from Plugins menu with menu error:<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">java.lang.NegativeArraySizeException<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at loci.formats.MinMaxCalculator.openBytes(MinMaxCalculator.java:263)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at loci.formats.ReaderWrapper.openBytes(ReaderWrapper.java:308)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at loci.formats.ReaderWrapper.openBytes(ReaderWrapper.java:308)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at loci.plugins.util.ImageProcessorReader.openProcessors(ImageProcessorReader.java:190)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at loci.plugins.in.ImagePlusReader.readProcessors(ImagePlusReader.java:416)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at loci.plugins.in.ImagePlusReader.readPlanes(ImagePlusReader.java:380)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at loci.plugins.in.ImagePlusReader.readImage(ImagePlusReader.java:277)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at loci.plugins.in.ImagePlusReader.readImages(ImagePlusReader.java:238)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at loci.plugins.in.ImagePlusReader.readImages(ImagePlusReader.java:216)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at loci.plugins.in.ImagePlusReader.openImagePlus(ImagePlusReader.java:114)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at loci.plugins.in.Importer.readPixels(Importer.java:150)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at loci.plugins.in.Importer.run(Importer.java:89)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at loci.plugins.LociImporter.run(LociImporter.java:81)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at ij.IJ.runUserPlugIn(IJ.java:193)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at ij.IJ.runPlugIn(IJ.java:160)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at ij.Executer.runCommand(Executer.java:127)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at ij.Executer.run(Executer.java:64)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                at java.lang.Thread.run(Unknown Source)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:9.0pt;font-family:"Kalinga","sans-serif"">________________________________________________________<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:9.0pt;font-family:"Kalinga","sans-serif"">Michael Cammer, Assistant Research Scientist<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:9.0pt;font-family:"Kalinga","sans-serif"">Skirball Institute of Biomolecular Medicine<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:9.0pt;font-family:"Kalinga","sans-serif"">Lab: (212) 263-3208  Cell: (914) 309-3270<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
</body>
</html>