Hi Will,<div><br></div><div>It is just a general question at the moment. I wanted to get some base information before meeting with the researcher next week. I should be able to get more detailed requirements then.</div><div>
<br></div><div>Thanks for your help,</div><div><br></div><div>Kim<br><br><div class="gmail_quote">On 25 May 2012 18:08, Will Moore <span dir="ltr"><<a href="mailto:will@lifesci.dundee.ac.uk" target="_blank">will@lifesci.dundee.ac.uk</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div style="word-wrap:break-word"><div>Forwarding to the list:</div><div><br></div>Apologies, I only replied to Kim and forgot to cc the list with this....<div>
<div class="h5"><div><br></div><div><div><div>On 23 May 2012, at 16:37, Will Moore wrote:</div><br><blockquote type="cite"><div style="word-wrap:break-word">Hi Kim,<div><br></div><div> You are correct that we support various EM file formats.</div>
<div><br></div><div>We have been working with the EM-Databank at EBI to use develop OMERO for the EM community.</div><div><br></div><div>Part of this work is to use OMERO to host some of the EM-databank data.</div><div><br>
</div><div>We've also been looking at how you might use OMERO to process EM data, using </div><div>existing EM software packages:</div><div><br></div><div>E.g. <a href="http://cvs.openmicroscopy.org.uk/snapshots/movies/omero-4-2/mov/Scripting4.mov" target="_blank">http://cvs.openmicroscopy.org.uk/snapshots/movies/omero-4-2/mov/Scripting4.mov</a></div>
<div><br></div><div><br></div><div>We'd be interested in hearing about your EM data management / processing requirements, questions etc.</div><div><br></div><div>  Thanks for your interest,</div><div><br></div><div>  Will. </div>
<div><br></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div><div><div>On 21 May 2012, at 07:44, Kim Linton wrote:</div><br><blockquote type="cite">Hi There,<div><br></div><div>I am interested to see if anyone has used OMERO for Electron Microscopy?</div>
<div><br></div><div>From what I can tell the file format are part of bioformats. </div><div><br></div><div>Cheers,</div>
<div><br></div><div>Kim<br clear="all"><div><br></div>-- <br><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:medium"><table style="padding-left:0px;padding-right:0px;padding-top:0px;border-collapse:collapse;width:832px;padding-bottom:0px;background-repeat:initial initial" cellpadding="0">

<tbody><tr><td style="margin-top:0px;margin-right:0px;margin-bottom:0px;margin-left:0px;font-family:arial,sans-serif;vertical-align:top;padding-top:0px;padding-right:0px;padding-bottom:0px;padding-left:0px"><div style="padding-top:0px;padding-right:0px;padding-bottom:1px;padding-left:0px">

<div><div style="padding-top:4px;padding-right:8px;padding-bottom:4px;padding-left:8px"><div><div style="clear:both;padding-bottom:0px"><div style="margin-bottom:10px;border-right-width:1px;border-bottom-width:1px;border-left-width:1px;border-top-style:solid;border-right-style:solid;border-bottom-style:solid;border-left-style:solid;border-top-color:rgb(239,239,239);border-right-color:rgb(239,239,239);border-left-color:rgb(239,239,239);border-bottom-color:rgb(226,226,226);border-top-width:0px;border-top-left-radius:7px 7px;border-top-right-radius:7px 7px;border-bottom-right-radius:7px 7px;border-bottom-left-radius:7px 7px;width:583px">

<div style="border-bottom-width:1px;padding-top:3px;border-top-style:solid;border-top-left-radius:7px 7px;border-right-style:solid;border-bottom-color:rgb(188,188,188);border-top-width:1px;border-bottom-style:solid;border-top-right-radius:7px 7px;border-top-color:rgb(188,188,188);border-left-color:rgb(188,188,188);border-left-style:solid;border-right-color:rgb(188,188,188);border-bottom-right-radius:7px 7px;border-right-width:1px;border-left-width:1px;border-bottom-left-radius:7px 7px">

<div><div><div><div><div style="font-size:13px;margin-top:5px;margin-right:15px;margin-bottom:5px;margin-left:15px;padding-bottom:20px"><div><div style><font color="#888888">Kim Linton<br>Senior Research Systems Facilitator<br>

Monash e-Research Centre<br>Building 75<br>Monash University<br>Clayton Victoria 3800, Australia<br>Ph:      <a value="+61399058681" style="color:rgb(0,0,204)">+61 3 99020712</a></font></div><div><font><span style="color:rgb(136,136,136)">Mob:    </span><font color="#3333ff">0408 972 629</font><font color="#0000cc"><br>

</font>Fax:    <a value="+61399020193" style="color:rgb(0,0,204)">+61 3 9902-0193</a><br>Email:  <a href="mailto:kim.linton@monash.edu" style="color:rgb(0,0,204)" target="_blank">kim.linton@monash.edu</a><br>Web:    <a href="http://www.monash.edu.au/eresearch" style="color:rgb(0,0,204)" target="_blank">http://www.monash.edu.au/eresearch</a></font></div>

</div><div><font color="#999999">Part time: Mon, Tues, Thurs & Fri</font></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></td></tr></tbody></table></span><div><font color="#888888" face="arial, sans-serif"><span style="border-collapse:collapse"><br>

</span></font></div><br>
</div>
_______________________________________________<br>ome-users mailing list<br><a href="mailto:ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk" target="_blank">ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk</a><br><a href="http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users" target="_blank">http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users</a><br>
</blockquote></div><br></div></div></blockquote></div><br></div></div></div></div><br>_______________________________________________<br>
ome-users mailing list<br>
<a href="mailto:ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk">ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk</a><br>
<a href="http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users" target="_blank">http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users</a><br>
<br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:medium"><table style="padding-top:0px;padding-right:0px;padding-bottom:0px;padding-left:0px;border-collapse:collapse;background-color:rgb(255,255,255);width:832px;background-repeat:initial initial" cellpadding="0">
<tbody><tr><td style="margin-top:0px;margin-right:0px;margin-bottom:0px;margin-left:0px;font-family:arial,sans-serif;vertical-align:top;padding-top:0px;padding-right:0px;padding-bottom:0px;padding-left:0px"><div style="padding-top:0px;padding-right:0px;padding-bottom:1px;padding-left:0px">
<div><div style="padding-top:4px;padding-right:8px;padding-bottom:4px;padding-left:8px"><div><div style="clear:both;padding-bottom:0px"><div style="margin-bottom:10px;border-right-width:1px;border-bottom-width:1px;border-left-width:1px;border-top-style:solid;border-right-style:solid;border-bottom-style:solid;border-left-style:solid;border-top-color:rgb(239,239,239);border-right-color:rgb(239,239,239);border-left-color:rgb(239,239,239);border-bottom-color:rgb(226,226,226);border-top-width:0px;border-top-left-radius:7px 7px;border-top-right-radius:7px 7px;border-bottom-right-radius:7px 7px;border-bottom-left-radius:7px 7px;width:583px">
<div style="padding-top:3px;background-color:rgb(255,255,255);border-right-width:1px;border-bottom-width:1px;border-left-width:1px;border-right-style:solid;border-bottom-style:solid;border-left-style:solid;border-right-color:rgb(188,188,188);border-bottom-color:rgb(188,188,188);border-left-color:rgb(188,188,188);border-top-width:1px;border-top-style:solid;border-top-color:rgb(188,188,188);border-top-left-radius:7px 7px;border-top-right-radius:7px 7px;border-bottom-right-radius:7px 7px;border-bottom-left-radius:7px 7px">
<div><div><div><div><div style="font-size:13px;margin-top:5px;margin-right:15px;margin-bottom:5px;margin-left:15px;padding-bottom:20px"><div><div style="color:rgb(0,0,0)"><font color="#888888">Kim Linton<br>Senior Research Systems Facilitator/Lead for the e-Research Portfolio<br>
Monash e-Research Centre<br>Building 75<br>Monash University<br>Clayton Victoria 3800, Australia<br>Ph:      <a value="+61399058681" style="color:rgb(0,0,204)">+61 3 99020712</a></font></div><div><font><span style="color:rgb(136,136,136)">Mob:    </span><font color="#3333ff">0408 972 629</font><font color="#0000cc"><br>
</font>Fax:    <a value="+61399020193" style="color:rgb(0,0,204)">+61 3 9902-0193</a><br>Email:  <a href="mailto:kim.linton@monash.edu" style="color:rgb(0,0,204)" target="_blank">kim.linton@monash.edu</a><br>Web:    <a href="http://www.monash.edu.au/eresearch" style="color:rgb(0,0,204)" target="_blank">http://www.monash.edu.au/eresearch</a></font></div>
</div><div><font color="#999999">Part time: Mon, Tues, Thurs & Fri</font></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></td></tr></tbody></table></span><div><font color="#888888" face="arial, sans-serif"><span style="border-collapse:collapse"><br>
</span></font></div><div></div><br>
</div>