<div class="gmail_quote">Hi,<div>I have a MAC running with Mac OS 10.6.8. I use ImageJ 1.46m to open all my files. Until last week, we had a Nikon microscope, with NIS element3. I could open the files with Bio-Formats, wich was really  really great. I used the stable version and the trunk build version. We updated our NIS element, and all the acquisition made with NIS element4 cannot be opened with Bio-formats. The export mode of NIS element viewer for mac, is horrible since it save each picture individually...and I have 4D acquisition with differents xy points...I cannot work with the viewer it will putt a mess in my computer!</div>

<div>Here is the message I have while trying to open and ND2 file from NIS element4:</div><div>
















<p class="MsoNormal"><b>java.lang.IndexOutOfBoundsException: Index: 0, Size: 0</b></p>

<p class="MsoNormal"><b>            at
java.util.ArrayList.RangeCheck(ArrayList.java:547)</b></p>

<p class="MsoNormal"><b>            at
java.util.ArrayList.get(ArrayList.java:322)</b></p>

<p class="MsoNormal"><b>            at
loci.formats.in.NativeND2Reader.initFile(NativeND2Reader.java:587)</b></p>

<p class="MsoNormal"><b>            at
loci.formats.FormatReader.setId(FormatReader.java:1091)</b></p>

<p class="MsoNormal"><b>            at
loci.formats.DelegateReader.setId(DelegateReader.java:232)</b></p>

<p class="MsoNormal"><b>            at
loci.plugins.in.ImportProcess.initializeFile(ImportProcess.java:480)</b></p>

<p class="MsoNormal"><b>            at
loci.plugins.in.ImportProcess.execute(ImportProcess.java:144)</b></p>

<p class="MsoNormal"><b>            at
loci.plugins.in.Importer.showDialogs(Importer.java:139)</b></p>

<p class="MsoNormal"><b>            at
loci.plugins.in.Importer.run(Importer.java:77)</b></p>

<p class="MsoNormal"><b>            at
loci.plugins.LociImporter.run(LociImporter.java:79)</b></p>

<p class="MsoNormal"><b>            at
ij.IJ.runUserPlugIn(IJ.java:184)</b></p>

<p class="MsoNormal"><b>            at
ij.IJ.runPlugIn(IJ.java:151)</b></p>

<p class="MsoNormal"><b>            at
ij.Executer.runCommand(Executer.java:127)</b></p>

<p class="MsoNormal"><b>            at
ij.Executer.run(Executer.java:64)</b></p>

<p class="MsoNormal"><b>            at
java.lang.Thread.run(Thread.java:680)</b></p>

<div><br></div><div>Please find in attached file, an acquisition I have from NIS element4.</div><div>Hope you will be able to update Bio-Formats, for the pleasure of all ImageJ users!</div><div>Thanks!</div><div>Best regards,</div>

<div><br></div><div>Chloë</div><div><br></div>-- <br><div><div><span style="color:rgb(51,51,51);font-family:arial,helvetica,sans-serif"><i>Chloë van Oostende</i></span></div><font color="#333333" face="arial, helvetica, sans-serif"><i>PhD molecular and plant cell biology</i></font><div>

<span style="border-collapse:collapse"><font face="arial, helvetica, sans-serif"><br><font color="#333333" style="font-style:italic">Department of Biology</font><br><font color="#333333" style="font-style:italic">Concordia University</font><br>

<font color="#333333" style="font-style:italic">7141 Sherbrooke Street West</font><br><font color="#333333" style="font-style:italic">SP-553.05</font><br><font color="#333333" style="font-style:italic">Montreal, Quebec</font><br>

<i><font color="#333333">Canada H4B 1R6</font></i></font><i><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#333333"><br></font></i></span></div><div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#333333">Lab: <a href="tel:%28514%29%20848-2424" value="+15148482424" target="_blank">(514) 848-2424</a><span> ext.5983</span></font></i></div>

<div><i><font face="arial, helvetica, sans-serif"><span><br></span></font></i></div><div><div><i><a href="http://www.chloevanoostende.net/" target="_blank">http://www.chloevanoostende.net</a></i></div></div></div></div></div>