Hi Christian,<br><br>I am forwarding your question to the OME-users mailing list.<br><br>Regards,<br>Curtis<br><br><br><div class="gmail_quote">---------- Forwarded message ----------<br>From: <b class="gmail_sendername"></b> <span dir="ltr"><<a href="mailto:cawurm@web.de">cawurm@web.de</a>></span><br>

Date: Mon, Apr 16, 2012 at 11:15 AM<br>Subject: [Software Feedback] bioformats, matlab & Leica Files<br>To: <a href="mailto:ctrueden@wisc.edu">ctrueden@wisc.edu</a><br><br><br>Christian Wurm sent a message using the contact form at <a href="http://loci.wisc.edu/contact" target="_blank">http://loci.wisc.edu/contact</a>.<br>


<br>
Dear Sir or Madam,<br>
I try to use bioformats to import Leica .lif-Files into matlab using the bfopen.m script.<br>
Opening single images, series etc works very well.<br>
<br>
To evaluate the data I further need to import the metadata of the files as described in your info. Especially I'm interested in the stack sizes and voxel sizes in x, y and z. After that I try to retrieve the data of interest by using 'metadata.get', unfortunately I constantly end up with empty variables ....<br>


Alternatively I have all metadata in a single variable.<br>
Could you please tell me how to retrieve the voxel and stack sizes from the metadata file?!<br>
Thanks in advance,<br>
Christian<br>
<br>
<br>
<br>
</div><br>