Hi Christophe,<br><br><blockquote style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;" class="gmail_quote"><p class="MsoNormal">Has anybody of you managed to interface Imaris with Omero ?</p>


<p class="MsoNormal">I would like to import pictures for automatic processing directly into Imaris.</p></blockquote>
<br>Another possibility might be to use Imaris 7.2's ImarisXT extension for Fiji/ImageJ integration, together with the OMERO plugin for ImageJ. I have not tried it, and the functionality is limited at the moment, but it may work to get your images from OMERO into Imaris.<br>

<br>-Curtis<br><br><div class="gmail_quote">On Tue, Jul 19, 2011 at 3:00 AM, Christophe TREFOIS <span dir="ltr"><<a href="mailto:christophe.trefois@uni.lu">christophe.trefois@uni.lu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">







<div link="blue" vlink="purple" lang="EN-US">
<div>
<p class="MsoNormal">Dear Ome-users,<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal">Has anybody of you managed to interface Imaris with Omero ?<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">I would like to import pictures for automatic processing directly into Imaris.<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal">For now, the only way I see is through Imaris’s Matlab XT interface, but it seems rather tedious.<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Since you’d need to go Omero -> Omero Matlab -> Imaris XT -> Imaris.<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal">Any hints, tips, suggestions are welcome.<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal">Kind Regards,<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal">--<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Christophe<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:9.0pt;color:#7F7F7F">................................................................................<u></u><u></u></span></b></p>
<p style="margin-right:0in;margin-bottom:3.0pt;margin-left:0in">
<b><span style="font-size:10.0pt;color:gray">Dipl.-Ing. Christophe TREFOIS</span></b><span style="font-size:9.0pt;color:#7F7F7F"><br>
</span><span style="font-size:9.0pt;color:gray">PhD Student<u></u><u></u></span></p>
<p style="margin-right:0in;margin-bottom:3.0pt;margin-left:0in">
<i><span style="font-size:9.0pt;color:gray">Ing. Sys. Com. Dipl. EPF<u></u><u></u></span></i></p>
<p style="margin-right:0in;margin-bottom:3.0pt;margin-left:0in">
<span style="font-size:9.0pt;color:gray"><br>
<img src="cid:image001.jpg@01CC45FA.9E358570" alt="Description: cid:image001.jpg@01CACC35.07191DE0" height="38" width="37"><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-right:0in;margin-bottom:6.0pt;margin-left:0in">
<span style="font-size:9.0pt;color:gray">Luxembourg Centre for Systems Biomedicine<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:3.0pt"><span style="font-size:8.0pt;color:gray">UNIVERSITY OF LUXEMBOURG</span><span style="font-size:10.0pt;color:gray"><br>
</span><span style="font-size:8.0pt;color:gray">CAMPUS LIMPERTSBERG<br>
162a, avenue de la Faïencerie<br>
L-1511 Luxembourg<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-right:0in;margin-bottom:3.0pt;margin-left:0in">
<span style="font-size:8.0pt;color:gray">T <a href="tel:%2B352%2046%2066%2044%206124" value="+3524666446124" target="_blank">+352 46 66 44 6124</a><br>
F <a href="tel:%2B352%2046%2066%2044%206949" value="+3524666446949" target="_blank">+352 46 66 44 6949</a><br>
</span><a href="http://www.uni.lu/" title="blocked::http://www.uni.lu/
http://www.uni.lu/" target="_blank"><span style="font-size:8.0pt;color:gray">www.lcsb.lu</span></a><span style="font-size:8.0pt;color:#7F7F7F"><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
</div>

<br>_______________________________________________<br>
ome-users mailing list<br>
<a href="mailto:ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk">ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk</a><br>
<a href="http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users" target="_blank">http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users</a><br>
<br></blockquote></div><br>