<div>I have found 2 more "bugs"</div>
<div> </div>
<div>1 - After merging ROIs on the Measurement Tool they are kept in some sort of directory (represented by several circles on top of each other). Any annotations that I write on those "main directories" are lost after closing the file, even if I save the ROIs before closing.</div>

<div> </div>
<div>2 - When I am viewing an image on one channel, but it is the other channel that is selected on the rendering controls, then I can't select on the rendering controls the channel I am viewing before switching first to the second channel. For example: I am viewing the green channel, but the red channel is selected on the rendering controls. If I want to change the levels of the green channel I have first to click on the red channel on the rendering controls, then click on the green channel on the rendering controls and only then I am able to change the levels for the green channel.</div>

<div>By contrast, if I click on a channel on the rendering controls it switches immediatly to that channel on the image display</div>
<div>Suggestion: when viewing a channel, switch automatically the rendering controls channel to the same that is being viewed</div>
<div> </div>
<div>Cheers,</div>
<div>Filipe Vilas-Boas<br><br></div>
<div class="gmail_quote">On Tue, Jan 26, 2010 at 5:38 PM, Filipe Vilas-Boas <span dir="ltr"><<a href="mailto:filipevb@gmail.com">filipevb@gmail.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote style="BORDER-LEFT: #ccc 1px solid; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; PADDING-LEFT: 1ex" class="gmail_quote">
<div>Hi,</div>
<div>I would like to point some "bugs" that I have encountered when using the measurement tools recently and also to give some suggestions:</div>
<div> </div>
<div>1 - When I merge ROIs the annotations are lost. If I only have an annotation on one of the ROIs, why not keep it? For example, I mark 1 cell with an ROI and write its name under the annotations. Then during the following timepoints I label the same cell and merge everything, but the annotation of th first ROI is lost. I suggest you make it stay there after merging.</div>

<div> </div>
<div>2 - After I merge ROIs I can go to "intensity results view" and press "add all". I have found a bug in this process that disorganizes all ROIs. If I have a list of ROIs for timepoints 1,2,3,4,5,etc, then they will appear like 2,5,1,3,4. I always have to sort the data after I export it to excel...</div>

<div> </div>
<div>3 - After I follow a cell in 3D throughout all those timepoints and it is finally identified with ROIs, I would like to be able to make a movie with images selected by the ROIs. For example, T=1 Z=3, T=2 Z=6, T=3 Z=4, T=4 Z=5, T=5 Z=1 (this meaning that the cell goes up and down throughout time). I know that I can go to each image and export it and then join everything together in ImageJ, for instance, but if Omero could make a movie using the list of the ROIs present in the Measurement Tool it would be great!</div>

<div> </div>
<div>Cheers,</div>
<div>Filipe Vilas-Boas</div></blockquote></div><br>