<div dir="ltr">Hi Susan,<br><br>Thanks for the file; the bug should be fixed in the latest trunk build of Bio-Formats, and hence the next release of OMERO.<br><br>If you want to update your existing OMERO installation with the fix, you will need to inject the new ZeissZVIReader into the OMERO.importer application. Before proceeding, please note that though this procedure should work in theory, it is untested and unsupported, and will void your warranty. :-)<br>
<br>First, download loci_tools.jar to your Desktop. Assuming you have installed OMERO.importer in your Applications folder with the default folder name (OMERO.clients-Beta3.0.1.mac), you can then run the following commands from the Terminal:<br>
<br>export SRC_JAR=~/Desktop/loci_tools.jar<br>export DEST_JAR=/Applications/OMERO.clients-Beta3.0.1.mac/OMERO.importer.app/Contents/Resources/Java/jar_1.jar<br>jar xvf $SRC_JAR 'loci/formats/in/ZeissZVIReader.class'<br>
jar xvf $SRC_JAR 'loci/formats/in/ZeissZVIReader$1.class'<br>jar uvf $DEST_JAR 'loci/formats/in/ZeissZVIReader.class'<br>jar uvf $DEST_JAR 'loci/formats/in/ZeissZVIReader$1.class'<br>rm -rf loci<br>
<br>This sequence of commands will update the jar_1.jar resource with the new ZeissZVIReader code.  You may want to back up your existing jar_1.jar file first, just in case.<br><br>-Curtis<br></div>