Hi Nicholas,<br><br>If you only want to extract pixel data from OME-XML files on disk, you could try the OMEXMLReader class in the Bio-Formats package:<br>    <a href="http://www.loci.wisc.edu/ome/formats.html">http://www.loci.wisc.edu/ome/formats.html
</a><br><br>If you do try it, let me know if you have any questions or problems.<br><br>-Curtis<br><br><div><span class="gmail_quote">On 8/15/06, <b class="gmail_sendername">Nicholas Lahens</b> <<a href="mailto:lahensn@canisius.edu">
lahensn@canisius.edu</a>> wrote:</span><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">Hi everyone,<br>I've been working on some java classes which interface with
<br>the OME-JAVA package, making it a bit easier to work with.<br>I'm currently working on a method which extracts metadata<br>from an OME-XML file. It uses the OMENode and ImageNode<br>classes to extract an image's basic dimensions. However, I
<br>run into trouble when I try to get the raw pixel data (ie the<br>byte array). Is there an easy built-in way to get this? The<br>pixel factory relies upon a login and session key, but I<br>would like to be able to extract the pixels directly from the
<br>file without loggin into the server. Do I need to convert the<br>node into an Element and then extract the pixel data directly<br>from the attribute? Thanks for any help.<br><br>Nick<br>_______________________________________________
<br>ome-users mailing list<br><a href="mailto:ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk">ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk</a><br><a href="http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users">http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users
</a><br></blockquote></div><br>