Hi Nicholas,<br><br>There is an OMEIS "UploadFile" call that returns FileIDs. Is this not what you want?<br><br>Also, as I said before, LOCI is currently working on integrating client-side upload/import logic with our Bio-Formats package. Yes, the pixels will be parsed on the client side, but Bio-Formats supports a wide variety of formats. The goal is to make the results as complete as possible (at least comparable to what you would get using OME's Perl-side import functionality).
<br><br>Lastly, in case you were not aware, the uploading code for both VisBio and the OME Plugin for ImageJ is based on a class called org.openmicroscopy.ds.tests.TestImport, part of the OME Java package.<br><br>-Curtis<br>
<br><div><span class="gmail_quote">On 7/27/06, <b class="gmail_sendername">Nicholas Lahens</b> <<a href="mailto:lahensn@canisius.edu">lahensn@canisius.edu</a>> wrote:</span><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
Hi again,<br>I've been experimenting with these importers by attempting to call them from a java application using an XMLRpcCaller. To be able to make use of these importers through java (and at the command line), I see that the desired files must already have been assigned file ID's and therefore must have been uploaded to OME in some fashion. Is there a way I can use OME-Java to select a file while working on a client machine (from the client machine's hard-drive) and upload it to the OME server/machine so that I can then use the imageImporters on it? Basically I'm trying to create a little test client that will allow a user to select an image file from his/her machine and have that file be uploaded and imported into OME. I have taken a look at the way VisBio does this, but that is reliant upon the VisBio datasets and VisAD for the interpretation for various image formats. OME's strength lies in its ability to interpret and properly import a wide variety of image types and I would like
<br> t!<br>!<br>o be able to just send it an image from a client machine and have OME process the file. Ideally I would like to continue using OME-Java to do this, but I'll take anything really. Thanks for all the help everyone has provided.
<br><br>Nick<br>_______________________________________________<br>ome-users mailing list<br><a href="mailto:ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk">ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk</a><br><a href="http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users">
http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users</a><br></blockquote></div><br>