Hi Nicholas,<br><br>We want to be able to do the same thing here at our lab, and have created a command-line utility called "omeul" (currently bundled with VisBio -- <a href="http://www.loci.wisc.edu/ome/visbio.html">
http://www.loci.wisc.edu/ome/visbio.html</a>) that uploads images to the OME server. The current implementation only uploads pixels without much (any) accompanying metadata, but we are currently working to migrate omeul into our new Bio-Formats library (
<a href="http://www.loci.wisc.edu/ome/formats.html">http://www.loci.wisc.edu/ome/formats.html</a>) and expand its functionality. We still have a ways to go, and everything is in a bit of flux right now, but we hope to have a more robust solution available for you soon. (The strategy we are going to pursue is much like what Ilya outlined in his reply.)
<br><br>-Curtis<br><br><div><span class="gmail_quote">On 7/13/06, <b class="gmail_sendername">Nicholas Lahens</b> <<a href="mailto:lahensn@canisius.edu">lahensn@canisius.edu</a>> wrote:</span><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
Hi Ilya,<br>Basically, I'm looking into using OME to store images and<br>image data for use with the Virtual Cell program. Since the<br>majority of VCell clients are offsite and we don't want to<br>open up a file directory on the OME machine for uploading
<br>files, having the ability to upload images at the application<br>level would be great. We could adapt the VCell to do this,<br>but it is preferable if OME could directly handle remote<br>image uploads. There's a bit of a crunch here right now, but
<br>tomorrow afternoon I'll have a chance to sit down with my<br>boss, go over the questions you posed and really work out<br>what we're looking for. Thanks for all the help.<br><br>Nick<br>_______________________________________________
<br>ome-users mailing list<br><a href="mailto:ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk">ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk</a><br><a href="http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users">http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users
</a><br></blockquote></div><br>