<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
<span style="font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px;" class="">Hi Mohanapriya,</span>
<div class=""><font face="Calibri, Helvetica, sans-serif" size="3" class=""><br class="">
</font></div>
<div class=""><font face="Calibri, Helvetica, sans-serif" size="3" class="">How are you converting the files, is it with the command line tools or with FIJI?</font></div>
<div class=""><font face="Calibri, Helvetica, sans-serif" size="3" class="">Do you have any options selected? Is a pattern string being used for the output name (for example </font><span style="color: rgb(69, 90, 100); line-height: 15.6px; orphans: 2; widows: 2; background-color: rgb(236, 239, 241);" class="">output_series_%s_Z%z_C%c_T%t.tiff</span></div>
<div class="">)?</div>
<div class=""><font face="Calibri, Helvetica, sans-serif" size="3" class=""><br class="">
</font></div>
<div class=""><font face="Calibri, Helvetica, sans-serif" size="3" class="">With Thanks,</font></div>
<div class=""><font face="Calibri, Helvetica, sans-serif" size="3" class="">David Gault</font></div>
<div class=""><font face="Calibri, Helvetica, sans-serif" size="3" class=""><br class="">
</font>
<div>
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On 5 Mar 2019, at 20:55, Narapareddy, Mohanapriya <<a href="mailto:mohanapriya.narapareddy@emory.edu" class="">mohanapriya.narapareddy@emory.edu</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div id="divtagdefaultwrapper" dir="ltr" style="font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: 12pt; font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif;" class="">
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class="">Hello i am tring to convert a .scn file to the tiff file. I am able to generate 13 tiff files but i am unable to load them in to the viewer. Can anyone tell me how can i <span style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif, serif, EmojiFont; font-size: 14.6667px;" class="">get
 bioformats to write</span><br style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif, serif, EmojiFont; font-size: 14.6667px;" class="">
<span style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif, serif, EmojiFont; font-size: 14.6667px;" class="">an interleaved image and not using<span style="font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif, serif, EmojiFont; font-size: 14.6667px;" class=""> plane-separate
 mode.</span></span></div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class=""><span style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif, serif, EmojiFont; font-size: 14.6667px;" class=""><span style="font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif, serif, EmojiFont; font-size: 14.6667px;" class=""><br class="">
</span></span></div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class=""><br class="">
</div>
<div id="Signature" class="">
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class="">Thanks,</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class="">Mohanapriya</div>
</div>
</div>
<br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<hr style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<font face="Arial" color="Gray" size="1" style="font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class=""><br class="">
This e-mail message (including any attachments) is for the sole use of<br class="">
the intended recipient(s) and may contain confidential and privileged<br class="">
information. If the reader of this message is not the intended<br class="">
recipient, you are hereby notified that any dissemination, distribution<br class="">
or copying of this message (including any attachments) is strictly<br class="">
prohibited.<br class="">
<br class="">
If you have received this message in error, please contact<br class="">
the sender by reply e-mail message and destroy all copies of the<br class="">
original message (including attachments).<br class="">
</font><span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; float: none; display: inline !important;" class="">_______________________________________________</span><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; float: none; display: inline !important;" class="">ome-users
 mailing list</span><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<a href="mailto:ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">ome-users@lists.openmicroscopy.org.uk</a><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<a href="http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users</a></div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</div>
<br>
<span style="font-size:10pt;">The University of Dundee is a registered Scottish Charity, No: SC015096</span>
</body>
</html>