<html>

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">

</head>

<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">

Hi Biofysikos,

<div class=""><br class="">

</div>

<div class="">It looks as though the bioformats_package jar is not part of the MATLAB path.</div>

<div class="">If you run the below it will quickly tell you if the jar can be found and if so which version. </div>

<div class=""><br class="">

</div>

<div class="">

<div style="margin: 0px; font-size: 10px; font-family: Courier;" class="">[status, version] = bfCheckJavaPath(true)</div>

<div class=""><br class="">

</div>

<div class="">Is the bioformats_package jar in the same folder as the rest of the MATLAB scripts?</div>

<div class=""><br class="">

</div>

<div class="">With Thanks,</div>

<div class="">David Gault</div>

<div class=""><br class="">

<div>

<blockquote type="cite" class="">

<div class="">On 19 Feb 2019, at 20:48, Biofysikos Biologos <<a href="mailto:biofysikos@gmail.com" class="">biofysikos@gmail.com</a>> wrote:</div>

<br class="Apple-interchange-newline">

<div class="">Hello,<br class="">

<br class="">

I have downloaded the latest Bioformats for MATLAB and it seems that<br class="">

the .jar file is not loading.<br class="">

<br class="">

The error I get is the following:<br class="">

<br class="">

Error using bfopen (line 100)<br class="">

Missing Bio-Formats library. Either add bioformats_package.jar to the<br class="">

static Java path or add it to the Matlab path.<br class="">

<br class="">

I have traced it to this line:<br class="">

<br class="">

reader = javaObject('loci.formats.in.FakeReader');<br class="">

<br class="">

Any help would be appreciated. Thanks.<br class="">

<br class="">

Biofysikos<br class="">

_______________________________________________<br class="">

ome-devel mailing list<br class="">

<a href="mailto:ome-devel@lists.openmicroscopy.org.uk" class="">ome-devel@lists.openmicroscopy.org.uk</a><br class="">

http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-devel<br class="">

</div>

</blockquote>

</div>

<br class="">

</div>

</div>

<br>

<span style="font-size:10pt;">The University of Dundee is a registered Scottish Charity, No: SC015096</span>

</body>

</html>