
<html>


<head>


<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">


</head>


<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">


<div class="">


<div class="">Dear all,<br class="">


<br class="">


Today we are releasing Bio-Formats 5.7.3 which includes the following changes:</div>


</div>


<div class=""><br class="">


</div>


<div class="">


<div class="">


<div class="">File format fixes and improvements:</div>


<div class="">


<ul class="">


<li class="">TIFF


<ul class="">


<li class="">fixed a NullPointerException when reading a TIFF file from the root system directory</li><li class="">improved support for large images that are stored as a single uncompressed tile with multiple interleaved channels</li></ul>


</li><li class="">MRC (Medical Research Council)


<ul class="">


<li class="">added support in original metadata for the fields ‘ISPG' and 'Is data cube'</li></ul>


</li><li class="">TillPhotonics TillVision


<ul class="">


<li class="">directory listings for .pst files are now sorted</li></ul>


</li><li class="">MetaMorph


<ul class="">


<li class="">directory listings are now sorted during file initialization</li></ul>


</li><li class="">Amira Mesh


<ul class="">


<li class="">now supports Avizo in the file header in addition to the existing support for AmiraMesh</li></ul>


</li><li class="">Becker & Hickl SPCImage


<ul class="">


<li class="">added a fix for IllegalArgumentException when reading files with compressed data</li></ul>


</li><li class="">Zeiss CZI


<ul class="">


<li class="">fixed an IndexOutOfBoundsException when creating ROI objects</li></ul>


</li></ul>


</div>


<div class=""><br class="">


</div>


<div class="">Bug fixes and improvements:</div>


<div class="">


<ul class="">


<li class="">removed unused target utils-formats-api from ant build</li><li class="">automated Memoizer tests updated to use UUID for generating unique memo file directories</li><li class="">detect and fix Findbugs' SBSC_USE_STRINGBUFFER_CONCATENATION using StringBuilder</li><li class="">configuration files for the automated test suite now use raw physical size rather than formatted size</li><li class="">added first version of Dockerfile for running the automated test suite standalone</li></ul>


</div>


<div class="">Documentation improvements:</div>


<div class="">


<ul class="">


<li class="">added a <a href="https://github.com/openmicroscopy/bioformats/blob/develop/SUPPORT.md" class="">support</a> page to the Bio-Formats project</li><li class="">updated reference URLs for the Aperio ImageScope and Micro-Manager</li><li class="">documented issues with conflicts in the <a href="https://docs.openmicroscopy.org/bio-formats/5.7.3/developers/components.html#forks-jai" class="">JAI ImageIO component</a></li><li class="">clarified the default values of HCS keys for fake images in the documentation for <a href="https://docs.openmicroscopy.org/bio-formats/5.7.3/developers/generating-test-images.html" class="">Generating test images</a></li><li class="">corrected external links which failed automatic link checking</li></ul>


</div>


</div>


</div>


<div class=""><br class="">


</div>


<div class="">Full details can be found at <a href="https://docs.openmicroscopy.org/bio-formats/5.7.3/about/whats-new.html" class="">https://docs.openmicroscopy.org/bio-formats/5.7.3/about/whats-new.html</a><br class="">


<br class="">


The software is available at:<br class="">


<a href="https://www.openmicroscopy.org/bio-formats/downloads/" class="">https://www.openmicroscopy.org/bio-formats/downloads/</a><br class="">


and will shortly be available from the Java-8 update site for Fiji users.<br class="">


<br class="">


Any problems or comments, please use the OME Forums or mailing lists:<br class="">


<br class="">


<a href="http://www.openmicroscopy.org/support" class="">http://www.openmicroscopy.org/support</a><br class="">


<br class="">


<br class="">


</div>


<div class="">Regards,<br class="">


<br class="">


The OME Team</div>


<br>


<span style="font-size:10pt;">The University of Dundee is a registered Scottish Charity, No: SC015096</span>


</body>


</html>