<div dir="ltr"><div><br></div><div>Hello together,</div><div><br></div><div>the VSI/ETS images might contain several nested images, e.g. one overview images and several high-res 'sub-images' (the ets files).</div><div>If one opens an ETS file with scifio reader it opens not the selected ETS (sub-)image, bit instead it refers to the assigned VSI image which will open</div><div>the first (or overview) sub-image - which might be different to the selected ETS image.  </div><div> </div><div>Referring to </div><div><a href="http://lists.openmicroscopy.org.uk/pipermail/ome-users/2015-July/005506.html">http://lists.openmicroscopy.org.uk/pipermail/ome-users/2015-July/005506.html</a><br></div><div><br></div><div>the solution is to set </div><div>reader.setFlattenedResolutions('false');<br></div><div><br></div><div>however, this only holds for a loci.formats.ImageReader, not for a io.scif.Reader.</div><div><br></div><div>Is there a solution for scifio as well?</div><div><br></div><div>Or - can I create a loci ImageReader and wrap it as a scifio reader (I read about a SCIFIOReader wrapper class, but can't find it anywhere).</div><div><br></div><div>Thanks for your help!</div><div><br></div><div>Regards,</div><div>Manuel</div><div><br></div><div class="gmail_signature"><br></div>
</div>

<br>
<div><font size="2"><br></font></div><div><font size="2">The information of this email and in any file transmitted with it is strictly confidential and may be legally privileged.</font></div><div><font size="2">It is intended solely for the addressee. If you are not the intended recipient, any copying, distribution or any other use of this email is prohibited and may be unlawful. In such case, you should please notify the sender immediately and destroy this email.</font></div><div><font size="2">The content of this email is not legally binding unless confirmed by letter.</font></div><div><font size="2">Any views expressed in this message are those of the individual sender, except where the message states otherwise and the sender is authorized to state them to be the views of the sender's company.</font></div><div><br></div>