<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
</head>
<body style="word-wrap:break-word">
<div>Hi Eric,</div>
<div><br>
</div>
<div>thanks for your feedback on the homebrew installation of OMERO.&nbsp;It looks like the Ice 3.4 binaries are not found in your path.</div>
<div><br>
</div>
<div>How did you install Ice 3.4 on your Mac? &nbsp;Did you download the binaries from the zeroc website, did you compile it manually from sources or did you use the the homebrew formula for Ice 3.4 (brew install ome/alt/ice)?</div>
<div><br>
</div>
<div>If using the Homebrew installation, it should symlink binaries, including slice2java, to /usr/local/bin. Is /usr/local/bin in your PATH.</div>
<div>If using binaries downloads/manual compilation, have you prepended /path_to_ice_3.4/bin to your PATH?</div>
<div><br>
</div>
<div>Cheers,</div>
<div>Sebastien</div>
<br>
<div>
<div>On 29 Jul 2012, at 16:12, Josh Moore wrote:</div>
<blockquote type="cite">
<p>Can you handle via the lists? Thanks</p>
<p>~Josh</p>
<div class="gmail_quote">---------- Forwarded message ----------<br>
From: &quot;Milton Tyler&quot; &lt;<a href="mailto:mft2xk@virginia.edu">mft2xk@virginia.edu</a>&gt;<br>
Date: Jul 23, 2012 7:47 PM<br>
Subject: Omero Installation Help<br>
To: &lt;<a href="mailto:josh.moore@gmx.de">josh.moore@gmx.de</a>&gt;<br>
<br type="attribution">
Hi Josh,<br>
<br>
I'm trying to install the latest version of Omero onto my Mac Pro (running OS X 10.7.4); however, I keep running into an error message at the &quot;$ brew install omero&quot; step while using homebrew, and I was wondering if you could help. &nbsp;Here is message I keep getting:
<div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>gl_labserv:~ gordonlaurie$ brew install omero</div>
<div>==&gt; Cloning <a href="https://github.com/openmicroscopy/openmicroscopy.git" target="_blank">
https://github.com/openmicroscopy/openmicroscopy.git</a></div>
<div>Updating /Library/Caches/Homebrew/omero--git</div>
<div>==&gt; Checking out tag v.4.4.0</div>
<div>Submodule 'components/bioformats' () registered for path 'components/bioformats'</div>
<div>Submodule 'components/tools/OmeroPy/scripts' () registered for path 'components/tools/OmeroPy/scripts'</div>
<div>Submodule 'docs/sphinx' () registered for path 'docs/sphinx'</div>
<div>==&gt; Patching</div>
<div>patching file build.xml</div>
<div>==&gt; ./build.py -Dice.home=/usr/local build-default</div>
<div>Error getting version for BUILD_NUMBER=</div>
<div>Execute failed: java.io.IOException: Cannot run program &quot;slice2java&quot;: error=2, No such file or directory</div>
<div><br>
</div>
<div>BUILD FAILED</div>
<div>/private/tmp/homebrew-omero-4.4.0-dCQg/build.xml:36: The following error occurred while executing this line:</div>
<div>/private/tmp/homebrew-omero-4.4.0-dCQg/components/antlib/resources/global.xml:310: Cannot find slice2java!</div>
<div><br>
</div>
<div>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; *******************************************************</div>
<div>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; Ice is not properly installed. Cannot find slice2java</div>
<div>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; *******************************************************</div>
<div><br>
</div>
<div>Total time: 0 seconds</div>
<div><br>
</div>
<div>==&gt; Build Environment</div>
<div>HOMEBREW_VERSION: 0.9.2</div>
<div>HEAD: 03744647cc9271abc8c2cb368702fc328ee9a0ec</div>
<div>CPU: 8-core 64-bit penryn</div>
<div>OS X: 10.7.4-x86_64</div>
<div>Xcode: 4.3.3</div>
<div>CLT: 4.3.0.0.1.1249367152</div>
<div>X11: 2.6.4 @ /usr/X11</div>
<div>CC: /usr/bin/clang</div>
<div>CXX: /usr/bin/clang&#43;&#43; =&gt; /usr/bin/clang</div>
<div>LD: /usr/bin/clang</div>
<div>CFLAGS: -Os -w -pipe -march=native -Qunused-arguments -mmacosx-version-min=10.7</div>
<div>CXXFLAGS: -Os -w -pipe -march=native -Qunused-arguments -mmacosx-version-min=10.7</div>
<div>CPPFLAGS: -isystem /usr/local/include</div>
<div>LDFLAGS: -L/usr/local/lib</div>
<div>MACOSX_DEPLOYMENT_TARGET: 10.7</div>
<div>MAKEFLAGS: -j8</div>
<div>Error: Failed executing: ./build.py -Dice.home=/usr/local build-default (omero.rb:27)</div>
<div>If `brew doctor` does not, this may help you fix or report the issue:</div>
<div>&nbsp; &nbsp; <a href="https://github.com/ome/homebrew-alt/issues/new" target="_blank">
https://github.com/ome/homebrew-alt/issues/new</a></div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>However, I have the latest version of Ice installed (version 3.4 for Mac 10.7) and in the same directory as everything else I'm using for this project. &nbsp;Could you point me in the right direction?</div>
<div><br>
</div>
<div>Thanks,</div>
<div>Eric Tyler</div>
<font color="#888888">-- <br>
Milton F. Tyler IV<br>
B. Sc. Biochemistry<br>
University of Virginia '14<br>
Kappa Kappa Psi, Vice President of Finance<br>
<br>
</font></div>
</div>
</blockquote>
</div>
<br>
<br>
The University of Dundee is a registered Scottish Charity, No: SC015096
</body>
</html>