
<html><head></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div>Hi Ingvar,</div><div><br></div>Just to be sure if the '10 minutes' is due to omero session timeout, you could change this with<div>E.g<br><div><br></div><div>$ bin/omero config set omero.sessions.timeout 3600000<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">                </span># timeout in millisecs!&nbsp;</div><div><br></div><div>You'll need to do&nbsp;</div><div>$ bin/omero admin restart</div><div><br></div><div>and check that this varies your Apache timeout.</div><div>Then at least we know for sure that it's the same 10 mins, not a coincidence.&nbsp;</div><div><br></div><div>&nbsp; Will</div><div><br></div><div><br><div><br><div><div>On 24 Apr 2012, at 16:37, Aleksandra Tarkowska wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite">


<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">


<div style="word-wrap:break-word">

<div>Hi Ingvar</div>

<div><br>

</div>

<div>Could you please send us&nbsp;<b>log files from&nbsp;omero/dist/var/log</b>,&nbsp;</div>

<div>as well as your&nbsp;<b>omero apache config file</b>&nbsp;and output of&nbsp;<b>bin/omero config get.</b></div>

<div><br>

</div>

<div>Could you please make sure you have web debugging on via:</div>

<div><br>

</div>

<div>bin/omero config get</div>

<div>and check if&nbsp;&nbsp;omero.web.debug is True</div>

<div><br>

</div>

<div>if not please set by:</div>

<div>bin/omero config set omero.web.debug True</div>

<div><br>

</div>

<div>Thanks</div>

<div><br>

</div>

<div><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; font-size: medium; ">

<div>

<div>Kind regards</div>

<div>Aleksandra</div>

<div><br>

</div>

<div>Aleksandra Tarkowska, M.Sc, Engg.</div>

<div>Software Engineer</div>

<div>Open Microscopy Environment</div>

<div><a href="http://www.openmicroscopy.org/">http://www.openmicroscopy.org</a></div>

</div>

<div><br>

</div>

</span></div>

<div></div>

<br>

<div>

<div>On 24 Apr 2012, at 16:21, Ingvar Lagerstedt wrote:</div>

<br class="Apple-interchange-newline">

<blockquote type="cite">

<div>Hello,<br>

<br>

I am trying to use the webemdb interface with Apache on an RHEL6WS box. &nbsp;I<br>

can access the pages fine as long as there is a valid session, but as soon<br>

as the session ends I get an AttributeError. &nbsp;If I at that point connect<br>

to the WebClient, I can then access webemdb for another 10 min.<br>

I do not see this behaviour when using the development server on a Mac, so<br>

suspect that this is down to either some security feature of RHEL6WS or<br>

Apache, or just some Apache settings that I am unfamiliar with. &nbsp;Any<br>

suggestions appreciated.<br>

<br>

The error message is attached, and the output from<br>

bin/omero admin diagnostics<br>

is given below<br>

<br>

<br>

================================================================================<br>

OMERO Diagnostics OMERO4.3.3<br>

================================================================================<br>

<br>

WARNING:omero.util.UpgradeCheck:UPGRADE AVAILABLE:Please upgrade to<br>

Beta-4.3.4 See <a href="http://trac.openmicroscopy.org.uk/omero">http://trac.openmicroscopy.org.uk/omero</a> for the latest<br>

version<br>

<br>

Commands: &nbsp;&nbsp;java -version &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;1.6.0 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;(/usr/bin/java)<br>

Commands: &nbsp;&nbsp;python -V &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;2.6.6 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;(/usr/bin/python)<br>

Commands: &nbsp;&nbsp;icegridnode --version &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;3.4.2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;(/usr/bin/icegridnode)<br>

Commands: &nbsp;&nbsp;icegridadmin --version &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;3.4.2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;(/usr/bin/icegridadmin)<br>

Commands: &nbsp;&nbsp;psql --version &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;8.4.9 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;(/usr/bin/psql)<br>

<br>

Server: &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;icegridnode &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;running<br>

Server: &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;Blitz-0 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;active (pid = 3200, enabled)<br>

Server: &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;DropBox &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;active (pid = 3218, enabled)<br>

Server: &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;FileServer &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;active (pid = 3244, enabled)<br>

Server: &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;Indexer-0 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;active (pid = 3220, enabled)<br>

Server: &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;MonitorServer &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;active (pid = 3243, enabled)<br>

Server: &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;OMERO.Glacier2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;active (pid = 3222, enabled)<br>

Server: &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;OMERO.IceStorm &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;active (pid = 3245, enabled)<br>

Server: &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;PixelData-0 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;active (pid = 3246, enabled)<br>

Server: &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;Processor-0 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;active (pid = 3251, enabled)<br>

Server: &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;Tables-0 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;inactive (disabled)<br>

Server: &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;TestDropBox &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;inactive (enabled)<br>

<br>

Log dir: &nbsp;&nbsp;&nbsp;/var/www/html/omero/dist/var/log exists<br>

<br>

Log files: &nbsp;Blitz-0.log &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;139.0 MB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;errors=8 &nbsp;&nbsp;<br>

warnings=77<br>

Log files: &nbsp;DropBox.log &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;22.0 KB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;errors=2 &nbsp;&nbsp;<br>

warnings=8<br>

Log files: &nbsp;FileServer.log &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;2.0 KB<br>

Log files: &nbsp;Indexer-0.log &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;218.0 KB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;errors=16 &nbsp;<br>

warnings=20<br>

Log files: &nbsp;MonitorServer.log &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;11.0 KB<br>

Log files: &nbsp;OMEROweb.log &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;3.0 MB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;errors=39 &nbsp;<br>

warnings=59<br>

Log files: &nbsp;OMEROweb_request.log &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;1.0 KB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;errors=0 &nbsp;&nbsp;<br>

warnings=13<br>

Log files: &nbsp;PixelData-0.log &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;133.0 KB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;errors=18 &nbsp;<br>

warnings=30<br>

Log files: &nbsp;Processor-0.log &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;30.0 KB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;errors=5 &nbsp;&nbsp;<br>

warnings=16<br>

Log files: &nbsp;Tables-0.log &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;n/a<br>

Log files: &nbsp;TestDropBox.log &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;n/a<br>

Log files: &nbsp;master.err &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;7.0 KB<br>

Log files: &nbsp;master.out &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;0.0 KB<br>

Log files: &nbsp;Total size &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;143.05 MB<br>

<br>

Parsing Blitz-0.log:[line:410] =&gt; Server restarted &lt;=<br>

Parsing Blitz-0.log:[line:623855] =&gt; Server restarted &lt;=<br>

Parsing Blitz-0.log:[line:872912] Your postgres hostname and/or port is<br>

invalid<br>

Parsing Blitz-0.log:[line:873012] =&gt; Server restarted &lt;=<br>

Parsing Blitz-0.log:[line:873506] =&gt; Server restarted &lt;=<br>

<br>

Environment:OMERO_HOME=/var/www/html/omero/dist<br>

Environment:OMERO_NODE=(unset)<br>

Environment:OMERO_MASTER=(unset)<br>

Environment:PATH=/usr/lib64/qt-3.3/bin:/usr/local/bin:/usr/bin:/bin:/usr/local/sbin:/usr/sbin:/sbin:/home/ingvar/bin<br>

Environment:ICE_HOME=/usr<br>

Environment:LD_LIBRARY_PATH=(unset)<br>

Environment:DYLD_LIBRARY_PATH=(unset)<br>

<br>

OMERO data dir: '/var/OMERO'<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">

</span>Exists? True<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre"> </span>Is writable? True<br>

OMERO.web status... [RUNNING] (PID 3474)<br>

<br>

The postgres error in Blitz-log happened when I got a new IP-address, and<br>

should not be relevant here. &nbsp;The problem describe was seen both before<br>

and after that event.<br>

<br>

<br>

Let me know if there are any further details that may be useful.<br>

/Ingvar<br>

<br>

---<br>

Ingvar Lagerstedt, PDBe - EMBL/EBI, A2-24<br>

Hinxton, Cambridge CB10 1SD, UK<br>

<span>&lt;webemdb_timeout.error&gt;</span>_______________________________________________<br>

ome-devel mailing list<br>

<a href="mailto:ome-devel@lists.openmicroscopy.org.uk">ome-devel@lists.openmicroscopy.org.uk</a><br>

<a href="http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-devel">http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-devel</a><br>

</div>

</blockquote>

</div>

<br>

<br>

The University of Dundee is a registered Scottish Charity, No: SC015096

</div>


_______________________________________________<br>ome-devel mailing list<br><a href="mailto:ome-devel@lists.openmicroscopy.org.uk">ome-devel@lists.openmicroscopy.org.uk</a><br>http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-devel<br></blockquote></div><br></div></div></div></body></html>