
<html>

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<style><!--

.hmmessage P

{

margin:0px;

padding:0px

}

body.hmmessage

{

font-size: 10pt;

font-family:Tahoma

}

--></style>

</head>

<body class='hmmessage'>

Hi Josh,<br><br>I don't seem to have a Processor-0.log... Could it be I haven't started it or something? <br>Did try getting nodes up manually but did say there where already running...<br>&nbsp;<br>And here is the output from diagnostic...<br><br>================================================================================<br>OMERO Diagnostics Beta4.2.1-r8614-Beta4.2-b41<br>================================================================================<br>

<br>Commands:&nbsp;&nbsp; java -version&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.6.0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; (/usr/bin/java)<br>Commands:&nbsp;&nbsp; python -V&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.6.2&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; (/usr/bin/python)<br>Commands:&nbsp;&nbsp; icegridnode --version&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3.3.1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; (/usr/bin/icegridnode)<br>Commands:&nbsp;&nbsp; icegridadmin --version&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3.3.1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; (/usr/bin/icegridadmin)<br>Commands:&nbsp;&nbsp; psql --version&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 8.4.4&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; (/usr/bin/psql)<br><br>Server:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; icegridnode&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; running<br>Server:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Blitz-0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; active (pid = 6747, enabled)<br>Server:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; DropBox&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; inactive (disabled)<br>Server:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; FileServer&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; active (pid = 6779, enabled)<br>Server:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Indexer-0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; active (pid = 6781, enabled)<br>Server:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; MonitorServer&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; inactive (disabled)<br>Server:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; OMERO.Glacier2&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; active (pid = 6783, enabled)<br>Server:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; OMERO.IceStorm&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; active (pid = 6785, enabled)<br>Server:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Processor-0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; inactive (disabled)<br>Server:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Repository-1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; error: node `repo' couldn't be reache&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; d:<br>the node is not active<br>Server:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Tables-0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; inactive (disabled)<br>Server:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; TestDropBox&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; inactive (enabled)<br><br>Log dir:&nbsp;&nbsp;&nbsp; /opt/OMERO.server-Beta-4.2.1/var/log exists<br><br>Log files:&nbsp; Blitz-0.log&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 138.0 MB&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; errors=147&nbsp; warnings=30&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3<br>Log files:&nbsp; DropBox.log&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 4.0 KB&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; errors=12&nbsp;&nbsp; warnings=0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>Log files:&nbsp; FileServer.log&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.0 KB<br>Log files:&nbsp; Indexer-0.log&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.0 MB&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; errors=2&nbsp;&nbsp;&nbsp; warnings=71&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>Log files:&nbsp; MonitorServer.log&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5.0 KB&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; errors=6&nbsp;&nbsp;&nbsp; warnings=0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>Log files:&nbsp; OMEROweb.log&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 13.0 KB&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; errors=1&nbsp;&nbsp;&nbsp; warnings=0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>Log files:&nbsp; Processor-0.log&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; n/a<br>Log files:&nbsp; Tables-0.log&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; n/a<br>Log files:&nbsp; TestDropBox.log&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; n/a<br>Log files:&nbsp; master.err&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 11.0 KB<br>Log files:&nbsp; master.out&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0 KB<br>Log files:&nbsp; node1.err&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3.0 MB<br>Log files:&nbsp; node1.out&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0 KB<br>Log files:&nbsp; node2.err&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3.0 MB<br>Log files:&nbsp; node2.out&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0 KB<br>Log files:&nbsp; Total size&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 145.66 MB<br><br>Parsing Blitz-0.log:[line:24] =&gt; Server restarted &lt;=<br>Parsing Blitz-0.log:[line:724411] =&gt; Server restarted &lt;=<br>Parsing Blitz-0.log:[line:724678] =&gt; Server restarted &lt;=<br>Parsing Blitz-0.log:[line:728931] =&gt; Server restarted &lt;=<br>Parsing Blitz-0.log:[line:733730] =&gt; Server restarted &lt;=<br>Parsing Blitz-0.log:[line:735476] =&gt; Server restarted &lt;=<br><br>Environment:OMERO_HOME=(unset)<br>Environment:OMERO_NODE=(unset)<br>Environment:OMERO_MASTER=(unset)<br>Environment:PATH=/usr/kerberos/sbin:/usr/kerberos/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; bin<br>Environment:ICE_HOME=(unset)<br>Environment:LD_LIBRARY_PATH=(unset)<br>Environment:DYLD_LIBRARY_PATH=(unset)<br><br>OMERO data dir: '/OMERO'&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Exists? True&nbsp;&nbsp;&nbsp; Is writable? True<br>OMERO.web status... [NOT STARTED]<br>================================================================================<br>


<br>Thanks,<br><br>Jerome.<br><br><br>&gt; Subject: Re: [ome-devel] OMERO scripts...<br>&gt; From: josh@glencoesoftware.com<br>&gt; Date: Wed, 12 Jan 2011 16:36:12 +0100<br>&gt; CC: ome-devel@lists.openmicroscopy.org.uk<br>&gt; To: jeromeavondo@msn.com<br>&gt; <br>&gt; Hi Jerome,<br>&gt; <br>&gt; On Jan 12, 2011, at 2:21 PM, Jerome Avondo wrote:<br>&gt; &gt; Hi all,<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; Firstly happy new year to everyone!! :)<br>&gt; <br>&gt; Same to you!<br>&gt; <br>&gt; &gt; I am having a few issues in trying the OMERO.script service. <br>&gt; &gt; I am trying to install and run the "Edit_Descriptions.py" example.<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; I am working with the admin scripts, so I did the following:<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; I created a new folder called jic_scripts under: lib/scripts/omero/jic_scripts<br>&gt; &gt; I copied in the "Edit_Descriptions.py" file.<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; Then in OMERO.insight the script is indeed visible, ie: shows up in the drop down menu, but when I try and run it I get the following error:<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; "Cannot load the script: 1414<br>&gt; &gt; Error: No Processor available<br>&gt; &gt; Please contact your administrator"<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; And this is all on a 4.2.1 omero install.<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; Any pearls of wisdom to help me out?<br>&gt; <br>&gt; Could you send us var/log/Processor-0.log as well as var/log/Blitz-0.log? The output of bin/omero admin diagnostics would also be helpful.<br>&gt; <br>&gt; Thanks,<br>&gt; ~Josh.<br>&gt; <br>&gt; &gt; Thanks for your time,<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; Jerome.<br>&gt; <br>                                               </body>

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