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<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">


</head>


<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">


<div class="">Dear Susana<br class="">


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I’m afraid it’s not clear to me  why this is so time-consuming so the following may not be of much help.<br class="">


However a few things that may be of use are:<br class="">


<br class="">


Are you aware that the Bio-Formats Matlab Toolbox allows you to write ome-tiffs directly from Matlab?<br class="">


See <a href="https://downloads.openmicroscopy.org/bio-formats/5.1.8/" class="">https://downloads.openmicroscopy.org/bio-formats/5.1.8/</a> and we can provide example code if needed/<br class="">


<br class="">


FLIMfit  can load multiple files using the File-> Load FLIM Dataset menu item and process them all <br class="">


in the same way so you could generate a large number of ome-tiffs and then process them in a single step.<br class="">


<br class="">


Also, please be aware that the source code is available from <a href="https://github.com/imperial-photonics/FLIMfit" class="">https://github.com/imperial-photonics/FLIMfit</a><br class="">


so you could, in theory simply call the c++ back end from matlab.<br class="">


<br class="">


There is an example file at <a href="https://github.com/imperial-photonics/FLIMfit/blob/master/FLIMfitFrontEnd/minimal_example.m" class="">https://github.com/imperial-photonics/FLIMfit/blob/master/FLIMfitFrontEnd/minimal_example.m</a><br class="">


but I’m not sure how recently that has been updated so it may well need some work.<br class="">


<br class="">


Best Wishes <br class="">


<br class="">


Ian <br class="">


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<div class=""><br class="">


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